小五郎等人代替感冒的阿笠博士到伊豆參加推理之旅。活動(dòng)規(guī)定，如果能夠找出推理之旅的主辦人就可以免費(fèi)住宿并可獲得一個(gè)包含某種病毒程序的磁盤。但是在旅途中不知什么人扮成暗夜公爵把柯南從欄桿上推了下去！之后柯南打電話詢問阿笠博士關(guān)于程序的事情得知了病毒的事情。晚餐后回房間時(shí)柯南和小蘭偶遇和明子發(fā)生口角的前田并被前田邀請(qǐng)卻觀看夜景。就在這時(shí)暗夜公爵卻墜樓生亡！

女性實(shí)業(yè)家兒島郁子在家中被殺，死的時(shí)候她身著睡衣臉敷面膜，在這個(gè)案件中有三名嫌疑人，TM證券營(yíng)業(yè)所的警衛(wèi)泉、死者的女兒千尋以及尸體發(fā)現(xiàn)者吉岡，他們都曾在死者生前與她見面，泉可以暫時(shí)排除嫌疑，因?yàn)榘赴l(fā)時(shí)他正好碰見小五郎，可千尋卻說(shuō)他有殺人動(dòng)機(jī)，三名嫌疑人陷入了互相揭露動(dòng)機(jī)之中，「兇手的指針」在他們?nèi)伺腔玻烧嫦嘀挥幸粋€(gè)。

身體變小后柯南轉(zhuǎn)入帝丹小學(xué)，并結(jié)識(shí)了步美、光彥和元太。某日，明星洋子來(lái)到毛利偵探事務(wù)所，說(shuō)總感覺有人暗中監(jiān)視她，為了更進(jìn)一步了解真相，毛利一行人來(lái)到洋子住處，可開門后居然有具死尸橫在門口，期間柯南發(fā)現(xiàn)了另一名演員優(yōu)子的耳環(huán)并且還注意到洋子的經(jīng)紀(jì)人山岸神態(tài)怪異，洋子、山岸、優(yōu)子到底誰(shuí)才是真正的兇手。

柯南去體育俱樂部館參觀時(shí)，正巧看到水上運(yùn)動(dòng)的西條、成瀨和木島發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的一幕，而體育俱樂部負(fù)責(zé)人佐伯和跳水代表西條也存在著某些不愉快。當(dāng)晚，小五郎接到目暮警官的電話說(shuō)西條死亡，因?yàn)闆]找到什么有用的線索，警方準(zhǔn)備以意外死亡結(jié)案，可是柯南注意到這是件謀殺案，柯南找到目擊證人并從他的繪畫中看透事情的真相，兇手一定就是那個(gè)人。

新一請(qǐng)小蘭到米花中心大樓的高級(jí)餐廳吃飯，而且還表示有重要的事情要告訴小蘭，可是卻遲遲說(shuō)不出口。就在此時(shí)突然傳出有人尖叫，原來(lái)是在電梯里面發(fā)現(xiàn)一名遭到槍殺的屍體。死者是在同大樓開電玩公司的社長(zhǎng)辰巳泰治。知道新一對(duì)殺人案很好奇的小蘭，叫新一先去破案再說(shuō)。當(dāng)新一趕到現(xiàn)場(chǎng)時(shí)，警方已經(jīng)到達(dá)，并且認(rèn)為應(yīng)該是為了搶錢而殺人。可是就只有新一認(rèn)為案件沒這麼單純...