小五郎受邀來到Nijimura品牌店，卻正好目擊社長仁地村被人綁架的畫面。社長的妻子兼副社長沙希，按照綁架犯的要求帶著一億贖金搭電車解救人質(zhì)，就在電車開往中戶呂鐵橋的時(shí)候，沙希按照指示將包包從窗戶丟到河里，而此刻正趕上泄洪，包包隨著增加的河水被沖走，待警方在五公里外的河岸發(fā)現(xiàn)時(shí)，贖金已經(jīng)被犯人拿走，而社長仁地村也被殺害。雖然事情已經(jīng)結(jié)束，但柯南和小五郎卻重返現(xiàn)場進(jìn)行調(diào)查，并發(fā)現(xiàn)……

小五郎受邀參加浦井食品創(chuàng)立八周年的紀(jì)念宴會(huì)，浦井社長在每年的宴會(huì)上都會(huì)進(jìn)行魔術(shù)或短劇之類的表演，所以賓客們也都非常期待他今年的表演，然而，宴會(huì)期間浦井社長卻大叫一聲倒了下來，就在大家都以為他今年表演是懸疑推理短劇時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)浦井社長真的停止了呼吸，警方查出他是中毒而死，當(dāng)時(shí)離死者最近的人就是他的夫人浦井星江。

在鈴木財(cái)團(tuán)的支持下龍馬展的保全措施做的非常好，而柯南在廁所思考之前遺失的龍馬遺物的時(shí)候基德忽然出現(xiàn)！柯南追著基德來到展館內(nèi)部的時(shí)候發(fā)現(xiàn)園子的袖子上粘到了奇怪奇怪的東西，而柯南也發(fā)現(xiàn)了基德所謂下雨的真實(shí)含義。基德按照約定來到了展館內(nèi)而樽見利用假的被盜信息來出售贗品的事實(shí)也最終曝光。

看過澤南留下的死亡訊息后，柯南知道了兇手的真面目，但是在揭發(fā)真相之前必須要破解這兩個(gè)密室殺人的手法，于是，他獨(dú)自來到比良坂的死亡現(xiàn)場進(jìn)行調(diào)查，并在這個(gè)房間內(nèi)的花瓶上發(fā)現(xiàn)了海報(bào)碎片，這條關(guān)鍵的線索讓他恍然大悟，原來兇手制造密室所利用的工具竟是海報(bào)，為了說明真相，他拜托高木和千葉警官場景重現(xiàn)，當(dāng)然，兇手就是那個(gè)人！

小五郎帶柯南和小蘭去菜園屋頂?shù)臅r(shí)候，發(fā)現(xiàn)了其中一塊菜田主人中村的尸體，表面上看像是因?yàn)槟_底打滑磕到了后腦勺的意外死亡，但柯南察覺到了其中的蹊蹺，警察找來屋頂菜園的其他三名種植者進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都沒有不在場的證明，并且其中一人的供詞卻引起了柯南的注意，當(dāng)大伙兒再次來到菜園進(jìn)行現(xiàn)場調(diào)查時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)了一塊奇怪的磚頭，而這無疑是找出兇手的關(guān)鍵線索。