步美某日經(jīng)過傳說中的鬼屋，而且還看到屋內(nèi)有鬼火！為了一探究竟柯南，步美，光彥還有元太一起出動來到這個傳說中的鬼屋。因為屋主被殺后家里的其他人就突然間不知去向，于是許多鬧鬼的傳說就此傳開。但在柯南和少年偵探團的各位探查之后發(fā)現(xiàn)了鬼屋中真的有人居住著！在調(diào)查了屋子之后柯南終于發(fā)現(xiàn)背后真正的秘密。最終殺害房子主人的兇手也自首承認(rèn)罪行。

柯南注意到這些音符并將其解讀，這時，當(dāng)?shù)氐睦暇煺f倉庫里有麻生圭二留下來的樂譜，這種重要線索柯南自然不會放過，他和警察一起去找樂譜，而這期間，一直精神怪異的西本上吊死亡，腳下還留有遺書，柯南推斷出這是他殺，當(dāng)在看到麻生圭二留下來的樂譜后，柯南斷定出了兇手，他利用變聲領(lǐng)結(jié)和廣播室說出真相。

柯南、小蘭和小五郎散步的時候，聽到附近大樓傳出女聲的尖叫，聞聲趕到的柯南等人發(fā)現(xiàn)不動產(chǎn)社長井本被殺，經(jīng)過排查，犯人鎖定在了曾經(jīng)賣漁具的寺沢、來借錢的土橋和協(xié)商離婚的妻子貴子三人身上，柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的法案手法后，利用簡單的道具，提醒小五郎，最終犯人難逃法網(wǎng)。

新一請小蘭到米花中心大樓的高級餐廳吃飯，而且還表示有重要的事情要告訴小蘭，可是卻遲遲說不出口。就在此時突然傳出有人尖叫，原來是在電梯里面發(fā)現(xiàn)一名遭到槍殺的屍體。死者是在同大樓開電玩公司的社長辰巳泰治。知道新一對殺人案很好奇的小蘭，叫新一先去破案再說。當(dāng)新一趕到現(xiàn)場時，警方已經(jīng)到達，并且認(rèn)為應(yīng)該是為了搶錢而殺人。可是就只有新一認(rèn)為案件沒這麼單純...

就在警察要強行帶走小五郎時，柯南在機械室和浜田的尸體上發(fā)現(xiàn)的有力證據(jù)幫他洗清了嫌疑，而目前最有可能殺人的就是上原，當(dāng)大家要暗中逮捕上原時，木下出面說自己去勸他自首，五分鐘后，屋內(nèi)響起槍聲，上原射傷木下逃跑。柯南重新回到竜神號調(diào)查并和鈴一起進入海軍山洞，卻在這里發(fā)現(xiàn)上原的尸體……