阿笠博士和小蘭帶少年偵探隊(duì)去露營(yíng)的時(shí)候，正巧碰到了一對(duì)因帳篷而發(fā)生口角的情侶，他們離開(kāi)之后，柯南等人占領(lǐng)了他們?cè)葴?zhǔn)備搭建帳篷的樹(shù)蔭，不料這時(shí)，正在帳篷里熟睡的小蘭被不明人士綁走，之后，警方在一個(gè)懸崖下發(fā)現(xiàn)了歹徒的車(chē)子，根據(jù)歹徒遺留下來(lái)的手機(jī)，小蘭很有可能在15點(diǎn)之前被人殺害，到底是誰(shuí)綁架了小蘭？柯南他們能否在15點(diǎn)之前找到小蘭呢？

與黑衣組織的戰(zhàn)斗告一段落，又回到了平靜的生活。某天，少年偵探隊(duì)獲知同樣就讀帝丹小學(xué)的雨宮翔子突然消失，據(jù)說(shuō)她和灰原十分相像，莫非黑衣組織的魔爪已經(jīng)深入學(xué)校？為找到翔子，放學(xué)后大家展開(kāi)了調(diào)查，期間還遇到神色可疑的老師，之后一行人找到了翔子失蹤前來(lái)過(guò)的便利店，并得知她在這里買(mǎi)了飲料、牛奶和小刀片，就在柯南他們百思不得解時(shí)，由美出現(xiàn)……

新田太太在路上偶遇買(mǎi)蛋糕的柯南和小五郎，于是，她急忙將小五郎拉到自己鄰居山本的住所，拜托他處理山本自殺的案件。從現(xiàn)場(chǎng)來(lái)看，死者山本是坐在沙發(fā)上，嘴巴大張用自己的改裝手槍結(jié)束生命，同時(shí)在扣動(dòng)扳機(jī)的瞬間也打破了裝有蝴蝶的恒溫箱，柯南認(rèn)為這是一起謀殺案，但是兇手是如何讓死者嘴巴大張，從而營(yíng)造出自殺狀態(tài)？

為了謹(jǐn)慎起見(jiàn)，佐藤拜托目暮警官分別派人監(jiān)視這三個(gè)可疑人士，就在大家擔(dān)心浩太，而不知如何是好時(shí)，浩太居然從外面回來(lái)了，看著平安無(wú)事的浩太，大伙兒懸著心終于放下了，可是人質(zhì)雖然回來(lái)，還是不知道犯人是誰(shuí)，佐藤主張一查到底，可將史卻不愿再追究下去，這時(shí)，高木警官注意到了腳底濕漉漉的浩太，詢(xún)問(wèn)之后，他便一人沖了出去……

由美說(shuō)今天并沒(méi)發(fā)生交通意外什么的，這可讓柯南犯了難，就在這時(shí)，便利店店長(zhǎng)的一句話(huà)給了柯南提示，為證實(shí)自己的想法他還去翻垃圾桶，所幸一切如他料想一般，于是，大家一起乘由美的車(chē)來(lái)到一座舊倉(cāng)庫(kù)，可遺憾的是他們并沒(méi)有找到翔子，反而看到了兩只小貓，知道了翔子的秘密后，柯南又在倉(cāng)庫(kù)外發(fā)現(xiàn)了出車(chē)禍的痕跡，難道說(shuō)翔子有危險(xiǎn)？