紀曉嵐義正詞嚴，歷數“監糧”案中上下官吏貪污、無恥的惡行，皇上萬分震驚。但鑒于牽扯人員太多，法不責眾，只將主犯王旦望正法，以震懾那些貪心亡命之徒。 貪官污吏被繩之以法，百姓歡呼雀躍，紀曉嵐不敢放松警惕，居安思危，某日，負責登記王旦望被抄沒家產的文書王斬柱，向紀曉嵐透露，王家贓物中不少貴重珍品已被私吞。 莫愁、小月閑來無事，拿和消遣，硬要他陪同逛街，三人信步來到一古玩店，竟有意外收獲，先后購得一枚蘇卿憐曾戴的頭飾和名畫《清明上河圖》。和明知這都是被官府沒收的贓物，命人告密，大內侍衛領兵查封了古玩店和當鋪，和又借機敲詐“監糧”案主審江南道御史陳輝祖。 從莫愁、小月的閑聊中，紀曉嵐得知贓物出處，陷入對這個“案中案”的沉思當中。 陳輝祖早就準備了一厚一薄兩本帳冊，應付府衙存檔，并決定將罪過推倒因害怕報復正逃之夭夭的王斬柱身上。

十四王爺心生惻隱之心，情急之中沖上前來與皇上閑談敘舊。皇上以半片金鎖設問王爺家事，引得冷眼旁觀的四姑娘憤憤不已。原來她與皇上有殺父之仇。皇上與王爺推杯換盞之際，忽然遭遇一群刺客。授命保駕的福康安率伏兵與之展開混戰。雖是兩主對陳，四姑娘的出手不凡還是深深地打動了福康安的心。 紀曉嵐以大內祭天的樂曲期望引起皇上的注意，莫愁警，迅速將之隔離，并趁機再次俘虜和。二人困在孤島之上，不免談天說地，無論是為官之術還是為人之道，紀曉嵐與和的見解都格格不入，雖然滔滔不絕，卻話不投機。用盡了心思，打碎了算盤，和棄紀曉嵐于不顧，兀自浮水沈生而去，驚魂未定，便與福康安密謀，一心要將調查云州貪污案的紀曉嵐置于死地，深恐他一旦自由，必定會對亦涉及此案的自己不利。 紀曉嵐被莫愁挾持到戲班，在后臺，他一邊憑借著驚人的記憶力默寫帳冊，一邊替不通文墨的小月書寫要上演的劇目招，那瀟灑自如的筆墨字跡張貼在人來人往熙熙攘攘的戲園門前，立刻引起了途經此地的皇上注意。

貴寧別有用心地將小月的真實身份告訴紐氏，紐氏懷疑海升與小月有染。紀曉嵐提醒海升防備和珅，并泄漏了小月的真實身份。海升聞言愕然。紐氏勸海升歸順和珅，遭到海升的斷然拒絕。紐氏佯裝上吊，卻不知貴寧暗中將上吊繩系成死扣，于是一命嗚呼。貴寧借機大鬧靈堂，指出紐氏是被海升謀害致死。步軍統領衙門經過尸檢確認紐氏為自縊身亡，貴寧不服。和珅讓貴寧咬定紐氏是他殺，并讓女婿綿慶以繼承皇位為餌拉攏步軍統領衙門總督綿思。綿恩同意將此案轉給刑部復檢。刑部復檢的結果與初檢結果如出一轍，貴寧仍不予認可。和珅表示一切均在自己掌握之中，指使貴寧告御狀，誣蔑驗尸官為迎合紀曉嵐而謊報案情。

紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

乾隆、和珅以及紀曉嵐將真相告訴太后，太后賜如玉無罪。得知皇上要召自己入宮，如玉婉拒。朱公公在和珅的指使下告訴戴沾，其在獄中所寫文章均被馮姓編纂官據為已有。戴沾氣憤不已，與馮扭打在一起，失手將馮打昏。戴沾外出求救時，朱公公將馮打死，陷害是戴沾所為。和珅轉而找到如玉，答應其入宮之后即免戴沾死罪。如玉為救戴沾，答應入宮。紀曉嵐設計詐朱公公說真相，戴沾被釋放。得知如玉為救自己而嫁入宮中，戴沾不顧一切聞人宮中。太后得知真相后赦戴沾無罪。皇上也成人之美，賜戴沾、如玉成婚。內務府齊蘇圖家出殯。民工古大力因為被齊家拖欠工錢而耿耿于懷，帶領眾民工在半路突襲出殯隊伍。棺材落地，撤出一地的金銀珠寶，其中還有印有內務府字樣的國庫元寶，惟獨不見尸體。齊蘇圖伯自己私吞國庫銀兩的罪行敗露，便殺死老仆齊平假裝出葬之人。受賄于齊家的和珅在朝上將罪責推到對手順天府尹身上，責其治安不利，使死者暴尸街頭。順天府尹因為懾于和珅的yin威而承認自己失職。