小五郎的學(xué)長(zhǎng)寺岡請(qǐng)他們吃烤肉的時(shí)候，突然接到一個(gè)名叫松山的人的電話，為勸說此人回歸正道，寺岡匆忙趕去約見的碼頭，小五郎也要求一同前往，小蘭和柯南尾隨其后，到達(dá)碼頭后，寺岡單獨(dú)去見松山，可不一會(huì)兒，大家就聽到了槍聲，松山因手槍走火意外死亡。暮目警官說手槍上除了寺岡和松山還有第三個(gè)人的指紋，柯南仔細(xì)思考之后，斷定這枚指紋就是讓犯人認(rèn)罪的完美證據(jù)。

就在警察要強(qiáng)行帶走小五郎時(shí)，柯南在機(jī)械室和浜田的尸體上發(fā)現(xiàn)的有力證據(jù)幫他洗清了嫌疑，而目前最有可能殺人的就是上原，當(dāng)大家要暗中逮捕上原時(shí)，木下出面說自己去勸他自首，五分鐘后，屋內(nèi)響起槍聲，上原射傷木下逃跑。柯南重新回到竜神號(hào)調(diào)查并和鈴一起進(jìn)入海軍山洞，卻在這里發(fā)現(xiàn)上原的尸體……

這時(shí)，二樓傳來老師們的慘叫，柯南和小蘭跑上去發(fā)現(xiàn)下田被人勒死，柯南立即開始找兇器，但并未找到，唯一能確定的是，兇手就在中村、米原和坂井之間，接下來的搜尋中，柯南在下田脖子上發(fā)現(xiàn)了頭發(fā)，兇手就是那個(gè)人！可是該通過誰之口揭穿兇手呢，園子昏睡不了解案情，正值苦惱之時(shí)，他想到以工藤的的身份讓小蘭用便攜電話說出真相，而小蘭卻在得知真相后痛哭不已。

在大富翁拉面王野口兵五郎的告別式上，大打出手的姊妹花野口由利與妹妹野口美紀(jì)。與野口家是世交，同時(shí)也來參加喪禮的鈴木園子，出面阻止兩人打架。就在此時(shí)，毛利蘭接到園子家里打來的電話，園子與由利竟然遭到綁架。新一與小蘭偕同刑警馬上來到野口家的公司，綁匪打電話來表示要求10億圓的鉆石當(dāng)作贖金...

大家一起去滑雪的時(shí)候，小五郎弄丟了別墅的鑰匙，三人正愁沒地兒住的時(shí)候，醫(yī)科大學(xué)的大山教授認(rèn)出小五郎并邀請(qǐng)他們?nèi)プ约旱膭e墅，并正巧碰上了大山教授學(xué)子們的聚會(huì)，期間，中原驅(qū)車下山買下酒菜，趁這個(gè)機(jī)會(huì)大家也都各自活動(dòng)，可中原回來后，卻發(fā)現(xiàn)大山教授被殺，柯南在現(xiàn)場(chǎng)根據(jù)教授留下的線索找到兇手。