湘云出行未遠，即被書商陳未元劫持，原來二人本是夫妻，陳未元貪圖謀利，視“紅樓”奇貨可居，來日待價而沽。湘云曾為曹雪芹校訂書稿，深知其中三味，愛書心切，惟恐被毀，攜之東躲西藏，夫妻反目成仇。看來要使《紅樓夢》得見天日，只能借助于皇上了，紀曉嵐遣皇差向遠在泰安的皇上獻上了幾冊散裝的書稿，易名為《石頭記》，請太后、皇上消遣閱讀。或許是旅途苦悶，太后讀后愛不釋手，連下八百里文書，催要下文。 莫愁搭救湘云，私闖陳宅，被福康安擒拿，紀曉嵐借口自己與莫愁、湘云等俱是《石頭記》作者，必須共同合作，才能盡早把續書寫出，交太后的差。在皇帝近侍藍侍衛的陪同下，名正言順地解救了莫愁、湘云，并再次拿到了“紅樓”書稿。 紀曉嵐以一堆白紙偽稱書稿，交官差千里迢迢，進獻急不可待欲知下文的皇上及太后。陳未元對紀曉嵐恨之入骨，慫恿福康安在紀曉嵐裝訂書稿時來一個人臟俱獲。

紀曉嵐在眾信徒面前一一揭露了李二設下的騙局。眾信徒醒悟，李二只得低頭認罪。紀曉嵐將當初留在海升之妻身上的四指掐痕與任五的手印做對比，兩者吻合，乾隆意識到海升被陷害。紀曉嵐讓海升與小芳做臨別遺言，兩人真情流露，隔壁的乾隆終于了解了冤情。乾隆下令嚴懲真兇，并賜海升與小芳完婚。早朝之時，乾降于閑談之中指出朝廷里存在結黨營私、欺上瞞下的現象，百官皆心虛不已，噤若寒蟬。下朝后，和珅竭力表示自己一身清白，卻偏偏遇到了正在等候自己的同黨——浙江巡撫盧焯。

四姑娘與福康安等陸續趕到云間寺以探虛實，得知呂長安已于前夜奔赴黃泉。 和恐濫用貢珠一事東窗事發，主動找紀曉嵐通融，紀曉嵐一針見血，指出煉取丹藥之方來自于十四王爺之府，與毒死奶娘的藥方本是出自一人之手。和不曾料到自己取寵獻媚之舉，已被別有用心者利用，趕緊做出俯首貼耳狀，求紀曉嵐指點迷津。 在宮中頤養天年的太后接天十四王爺孝敬來的七蓮子茶十分滿意，實為十四王爺心腹的何掌柜匆匆將煉就的“回春丹”獻給和，此物與七蓮子茶同服將是一劑人死地的毒藥。 呂長安在紀曉嵐的安排下以裝死之術掩人耳木哄騙了十四王爺派來的女殺手秋風、球月，在和的協助下，紀曉嵐又導演了一出游街示眾、公開庭審的好戲，不想卻被蒙在鼓里的太后欽差--杜小月攪得熱鬧，四姑娘起了疑心，鼓動小月去京城求見太后。

紀曉嵐夜讀時又接到被扔進窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀曉嵐夜探郭天，得到通報的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機救出瑤琴。紀曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調查國庫虧空一案。紀曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災為由取得真賬本。和珅模不透紀曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動身時救出瑤琴。

紀曉嵐不肯循親枉法，力數薛大老板之罪狀，皇上無言以對，和巧言令色，深通馬屁術和離間術，莫愁聞知老夫人既是貪案的罪魁禍首，想到為此犧牲的黃克明，舉劍直指老夫人，并慷慨陳詞，欲報仇血恨，皇上深為震驚，迫于情勢，決定親自出馬，弄清案情，查明真相。 紀曉嵐與和天生一對冤家對頭，一旦相見，便免不了冷嘲熱諷。和建議以無關緊要的人物做替罪羊洗清柳志夫人的污點，紀曉嵐豈相從，柳志夫人痛訴多年來失子之痛，才為彌補失落感，用金錢報仇世人。皇上矛盾不已，紀曉嵐毫不手軟，斷然判案，不惜身家性命。柳志夫人自知罪孽重，不忍再為難皇上毅然服毒自盡。 一日，紫禁城內，君臣又聚在一起，為奶娘命案一事產生歧義，和深知此案頗多詭異，不愿輕易牽掛上身，紀曉崗卻明察秋毫，知此中大有文章，正欲深入調查，御醫呂長安卻越獄逃跑。