在小蘭的跆拳道社學(xué)姐鏡堂奈奈美的邀請(qǐng)下，少年偵探團(tuán)的眾人來(lái)到了鏡堂家尋找傳聞中的寶藏，非常熱衷建筑的上一代家主鏡堂征太郎在這座宅邸中設(shè)下了各式各樣的機(jī)關(guān)，而沒(méi)有入口和窗戶(hù)的暗黑之塔也是其中之一，而在奈奈美帶領(lǐng)他們?cè)谡∷奶巺⒂^時(shí)突然聽(tīng)到了女性的慘叫聲，奈奈美的母親不幸從塔上墜亡，前去調(diào)查兇手的途中灰原卻不見(jiàn)了蹤影。

帶走柯南的女子真名是蒲川情奈，她是被三名強(qiáng)盜殺害的銀行員賢也的女友，為了替賢也復(fù)仇的她一再犯下罪行。同一時(shí)間小五郎等人借助安室的推理逐漸逼近事件的真相，并馬上前往最后一位搶劫犯的住處，另外阿笠博士和世良等人也趕了過(guò)來(lái)，而柯南已經(jīng)跟著情奈前往可能是最后一位搶匪的三位女性那里。

受百合香小姐之邀小五郎帶著小蘭和柯南前往了葡萄園，在那里他們看到了前來(lái)簽合同的山口先生，而百合香小姐的丈夫健吾卻帶著契約不知所蹤。水町帶來(lái)的契約上已經(jīng)有了健吾的簽名，在水町帶著小五郎等人參觀葡萄園時(shí)百合香小姐依舊沒(méi)能找到自己的丈夫，他們一起前往酒庫(kù)后才發(fā)現(xiàn)健吾已經(jīng)遇害，而除了水町之外其他的人都有不在場(chǎng)的證明。

接受汀小姐的邀請(qǐng)小五郎一行人來(lái)到了大濱海岸，在汀小姐的家里小五郎等人遇到了她的丈夫海四郎，兩人因?yàn)闆_浪的事情起了爭(zhēng)執(zhí)。傍晚海四郎找到小五郎等人表示汀小姐不見(jiàn)了，看到汀小姐發(fā)來(lái)的短訊后海四郎先行回到家中，而第二天早上小五郎等人卻在海灘上發(fā)現(xiàn)了汀小姐的尸體，而她的尸體旁邊卻沒(méi)有留下任何足跡。

和笹本小姐一起晨跑的高木警官在路上撿到了一個(gè)皮包，打開(kāi)之后里面竟是3千萬(wàn)的巨額鈔票，沒(méi)過(guò)多久鈔票的失主平沼先生便來(lái)到了警局。經(jīng)過(guò)調(diào)查之后高木警官發(fā)現(xiàn)平沼先生丟錢(qián)的時(shí)間有所出入，仔細(xì)觀察后的柯南得出了結(jié)論，平沼先生是在早上故意將錢(qián)放在路上，而他想把錢(qián)交給的則是有著晨跑習(xí)慣的笹本小姐，但他的用意卻讓眾人很困惑。