阿笠博士帶著少年偵探團到深山里挖竹筍的時候，車子突然出現故障，柯南等人被迫留在深山之中。為了避雨而來到這里別墅區的少年偵探團被一陣鋼琴聲所吸引，于是，大伙兒進入這棟別墅，雖然這里有人生活的痕跡卻沒有看到半個人影，而且留在現場的日記還寫著可怕的內容，之后大家決定找出日記中出現的被綁架男孩，這時，屋內突然停電，伴隨著少年偵探團的恐慌鋼琴聲再次響起。

這天小五郎在賽馬之后來到小酒館巧遇了同樣賽馬的幾位同好。在屋外抽煙的小五郎遇到了來找他的小蘭和柯南，就在眾人回到小酒館時忽然發現酒館老板娘被刺身亡！在警方調查了酒館的幾位客人之時發現扇小姐為了挽救自己的舞蹈班向老板娘借錢的事實，而其他幾位客人也多少有把柄被老板娘抓住。柯南在勘察現場后發現了犯人的身份！

解決了暗號事件回到日本的柯南終于恢復了正常的生活，在放學回家的路上元太提議大家進入即將拆遷的大樓內來玩捉迷藏。就在這時元太發現有奇怪的敲打墻壁的聲音，柯南發現這是有人發出的求救聲音，就在他們在搜尋的過程中發現了在檢查大樓的兩個工人。兩人告訴柯南他們那是他們發出的響聲不用在意但在柯南的推理下少年偵探團們開始尋找被困的人，就在這時之前的檢查工人卻抓住了小哀，究竟應該這應該辦！

小五郎受邀參加浦井食品創立八周年的紀念宴會，浦井社長在每年的宴會上都會進行魔術或短劇之類的表演，所以賓客們也都非常期待他今年的表演，然而，宴會期間浦井社長卻大叫一聲倒了下來，就在大家都以為他今年表演是懸疑推理短劇時，柯南發現浦井社長真的停止了呼吸，警方查出他是中毒而死，當時離死者最近的人就是他的夫人浦井星江。

為了消除基德偽裝成他人的可能，少年偵探團分別承擔起了看守四個臺座的重任，就在這時，屋內突然停電，只能聽見電流嗞嗞的聲音以及窗外吹進的風的呼呼聲，屋內很快恢復了光亮，但大家發現在這短短的一分鐘內，基德不動聲響的將柯南電暈打開中間的立柱盜走了麒麟角，灰原發現這四個臺座分別代表了四神獸，這或許與三水吉右衛門刻在柱子上的話相關，在沒有柯南的幫助下，少年偵探團能否找到被盜的麒麟角？