白夜團利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學忍具研究所。當大家的注意力全被雷門公司吸引時白夜團搶走了研究所的忍術資料，鹿臺意識到這一點后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團，在同伴們的掩護下鹿臺和博人追了上去，他們能阻止白夜團的陰謀嗎？

佐助等人朝著信的巢穴前進，途中他們遭到了眾多克隆體的攻擊，雖是克隆體但鳴人并沒打算下重手，在鳴人壓制克隆體時佐助與佐良娜先行一步援助小櫻。確定信沒有同伙后小櫻展開了攻勢，在和佐助匯合后信被完全壓制，所有的克隆體全部集中到了信的周圍，但他們做的第一件事竟然是殺死了信，在信不知道的情況下克隆體們實施著自己的計劃。

小櫻好不容易迎來了難得的假期，她和井野約好一起旅行，而乖巧的佐良娜則留下來看家。獨自乘坐雷車的佐良娜準備幫媽媽將玩偶送還給醫院里的孩子，但在下車的時候卻把包裹遺忘了，一向風評良好的她決定拋棄形象爬上雷車，但卻碰巧遇到了博人等人。無計可施的佐良娜遇到了蝶蝶，當她們去失物招領處時卻發現包裹被人誤領了。

尸澄真用紅霧結界將博人一行隔開，長十郎不慎陷入苦戰，而博人則對上了神樂。佐良娜和雷刀牙的持有者文淡展開了攻防，在彌漫著濃霧的水域上對戰雷系忍者讓佐良娜陷入劣勢，但她還是利用寫輪眼準確的找到了對方的位置。另一方面，長十郎掙脫束縛打敗了眼前的三人，博人的同伴們也開始了行動。

三人小隊集合的時候博人遲遲沒有來，巳月在與佐良娜閑聊的時想起了以前的自己。從病床上醒來的巳月完全不記得從前的事情，大蛇丸過來告訴他一個叫羅古的忍者奪走了他的記憶，而自己則是他的至親。雖然巳月心存疑慮但還是選擇相信了大蛇丸，但當他揭開羅古的面具后卻再次陷入了迷茫。