太后被紀曉嵐的肺腑之言所感動，答應出面參與調查。和珅的文字獄愈搞愈烈。和珅煽動乾隆命紀曉嵐將顏驥的藏書付之一炬，紀曉嵐巧設妙計保住藏書。如玉在和珅的安排下結識小月，小月對如玉的學識很是佩服并求教于如玉。看到小月的學問突飛猛進，紀曉嵐不禁對如玉產(chǎn)生好奇。小月將紀曉嵐介紹給如玉，紀曉嵐對如玉的品行頗為欣賞。和珅將摻有迷hun藥的煙草送給紀曉嵐，趁紀曉嵐神志不清時，和珅讓其寫下顏驥窩藏反書的奏章。如五發(fā)現(xiàn)家父的藏書均在紀曉嵐家中，于是誤認為紀曉嵐為霸占藏書而將顏驥迫害致死，不由對紀曉嵐更加仇恨。

紀曉嵐與和聯(lián)手派人護送御醫(yī)呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協(xié)助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產(chǎn)生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀曉嵐仔細看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫(yī)為如玉療傷，卻發(fā)現(xiàn)如玉實為女兒身。得知紀曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀曉嵐。紀曉嵐苦口婆心規(guī)勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀曉嵐《四庫全書》總纂官的職務，和珅幸災樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學，被乾隆指派到四庫館修書。

紀曉嵐從鴿子賣主口中得知鴿子可以傳信，聯(lián)想到和珅收購大量鴿子，紀曉嵐有所覺悟。趙青找到和珅，懇求其允許自己替哥哥考試。一曾經(jīng)被紀曉嵐救助過的翰林將和珅收買眾翰林替考生答卷作弊并由鴿子傳送的消息透露繪紀曉嵐。紀曉嵐命小月在適當?shù)臅r候燃放爆竹，以驅趕鴿群。趙青得知考生均要過“凈身池”很是擔心，她面露猶豫之色引起士兵的懷疑。正在兩人拉扯之時，紀曉嵐出現(xiàn)并堅決表示不會讓趙青進入考場。為了拉攏趙青為自己效力，和珅以趙青忠孝為由，懇請乾隆傳其入場，紀曉嵐卻以“無規(guī)矩不成方圓”為由大加反對。小月跟蹤和琳，發(fā)現(xiàn)了眾翰林答卷的密室，正當小月想要察看一番時，卻被和琳發(fā)現(xiàn)并打暈。小月醒來發(fā)現(xiàn)試卷已被鴿子帶走，便飛馬趕往考場。沒有小月的命令，等候放爆竹的人誰也不敢動手，眼睜睜地看著鴿群飛過。紀曉嵐將準備好的誘鴿放上天，鴿群在誘鴿的帶領下紛紛落地。小月趕到并下令放爆竹，結果鴿群受到驚嚇又再次飛上天，和珅幸災樂禍。得知自己高中，趙青深感愧疚，于大堂之上向乾隆揭露考試內幕。

紀曉嵐義正詞嚴，歷數(shù)“監(jiān)糧”案中上下官吏貪污、無恥的惡行，皇上萬分震驚。但鑒于牽扯人員太多，法不責眾，只將主犯王旦望正法，以震懾那些貪心亡命之徒。 貪官污吏被繩之以法，百姓歡呼雀躍，紀曉嵐不敢放松警惕，居安思危，某日，負責登記王旦望被抄沒家產(chǎn)的文書王斬柱，向紀曉嵐透露，王家贓物中不少貴重珍品已被私吞。 莫愁、小月閑來無事，拿和消遣，硬要他陪同逛街，三人信步來到一古玩店，竟有意外收獲，先后購得一枚蘇卿憐曾戴的頭飾和名畫《清明上河圖》。和明知這都是被官府沒收的贓物，命人告密，大內侍衛(wèi)領兵查封了古玩店和當鋪，和又借機敲詐“監(jiān)糧”案主審江南道御史陳輝祖。 從莫愁、小月的閑聊中，紀曉嵐得知贓物出處，陷入對這個“案中案”的沉思當中。 陳輝祖早就準備了一厚一薄兩本帳冊，應付府衙存檔，并決定將罪過推倒因害怕報復正逃之夭夭的王斬柱身上。