少年偵探團(tuán)在兒童跑腿活動(dòng)中，充當(dāng)活動(dòng)記錄。一行人跟在兒童小宏后面攝影，可是小宏總是亂跑，期間還曾跑進(jìn)過(guò)，一幢將要拆掉的廢棄大樓里，小宏在躲過(guò)了兩次人為制造的意外后，被人擄走，柯南從記錄的中發(fā)現(xiàn)了蛛絲馬跡，他們來(lái)到廢棄大樓，并在地下室找到了小宏和一具尸體，這時(shí)，兇手將少年偵探團(tuán)關(guān)到樓中，而外面拆除大樓已經(jīng)開(kāi)始，少年偵探團(tuán)能否逃過(guò)一劫？

米花博物館將要舉辦珠寶展，園子家的「黑暗星辰」也要參展，可在此之前，園子家收到了一封來(lái)自怪盜基德的盜取通知信，柯南解開(kāi)通知信的暗號(hào)后來(lái)到杯戶市立飯店屋頂，基德在月色中憑空到來(lái)，將警方內(nèi)部搞的一團(tuán)糟后，順利逃跑，并留下通知信說(shuō)他定會(huì)盜走「黑暗星辰」。宴會(huì)當(dāng)天，園子的母親給上船的每個(gè)人都發(fā)了一顆黑珍珠，混淆視聽(tīng)，可基德手法更高一籌，他偽裝成了鈴木會(huì)長(zhǎng)登上船只。

戶屋英子是服裝界的名設(shè)計(jì)師，但是她所設(shè)計(jì)的服裝卻搶先被其它的廠商發(fā)表上市。明明知道是她的秘書(shū)盜取商業(yè)機(jī)秘圖利轉(zhuǎn)售卻又無(wú)可奈何。這天小蘭被選為英子的模特和柯南，小五郎一起來(lái)到英子的公司。而就在這時(shí)突然發(fā)現(xiàn)英子的秘書(shū)美香被刺身亡。在勘察現(xiàn)場(chǎng)之后柯南最終發(fā)現(xiàn)了英子殺人的手法，而在鐵證面前，戶屋英子也承認(rèn)了自己的罪行。

小五郎三人陰錯(cuò)陽(yáng)差的搭上了簱本家的豪華游輪，并遇到新婚夫婦夏江和小武，這時(shí)，簱本當(dāng)家豪藏找孫女婿小武談話，他識(shí)破了小武是自己害死的對(duì)頭財(cái)誠(chéng)勇夫的兒子。當(dāng)大家都在餐廳用餐時(shí)，突然傳來(lái)管家鈴木的慘叫，豪藏遇害，大家把矛頭指向小武并將他關(guān)進(jìn)倉(cāng)庫(kù)，可是到了晚上，柯南又在夾板上發(fā)現(xiàn)了長(zhǎng)孫女秋江丈夫的尸體，被禁足的小武也不見(jiàn)了蹤影。

新一遭到某人綁架到白色房間，而且被迫回想起許多過(guò)去發(fā)生的案件。新一好像突然想到什麼，對(duì)著小蘭說(shuō)”這一切都是你做的”。可是就在此時(shí)，兩人突然被玻璃隔開(kāi)，房間里放出白色的煙霧，不久後兩人都失去了意識(shí)。當(dāng)新一醒來(lái)的時(shí)候，已經(jīng)離開(kāi)白色房間，而且在現(xiàn)場(chǎng)有很多警察。第一個(gè)反應(yīng)就是要找小蘭的他，卻發(fā)現(xiàn)法醫(yī)站在小蘭身邊，而且後來(lái)還告訴她小蘭已經(jīng)死掉的消息...