寒假的這天柯南發(fā)燒了休息，而原本約定好的在步美家的紙牌游戲也沒(méi)有辦法參加。就在和步美通電話(huà)時(shí)忽然有個(gè)叫做正南的小男孩說(shuō)有陌生人闖進(jìn)家中敲開(kāi)了步美家的門(mén)，但之后他的父母便過(guò)來(lái)把他帶走了。看似小孩子的惡作劇但柯南卻發(fā)現(xiàn)其實(shí)他們不是真的父母，正南可能真的面臨危險(xiǎn)！于是少年偵探團(tuán)的各位來(lái)到正南的家里一探究竟。

園子中學(xué)時(shí)的好友矢內(nèi)小姐拜托小五郎幫她重新調(diào)查姐姐的自殺案件，而她也是這次事件的目擊者之一。被警方認(rèn)定為自殺案件的這起事件還存在著很多疑點(diǎn)，事發(fā)當(dāng)天正在商量明年創(chuàng)立祭的矢內(nèi)小姐和顧問(wèn)児玉老師看到了受害人在模型社里自殺的一幕，第一個(gè)趕到現(xiàn)場(chǎng)的是受害人的未婚夫柴垣老師，而柯南在還原現(xiàn)場(chǎng)時(shí)看出了端倪。

為了趕上先搭上巴士前往滑雪場(chǎng)的少年偵探團(tuán)一行人，柯南和灰原只好請(qǐng)昴先生駕車(chē)前往，途中他們巧遇高木警官，正在和高木警官談話(huà)的時(shí)候事件發(fā)生了。趕往現(xiàn)場(chǎng)后他們看到了從公寓高樓墜落的遺體，案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)附近發(fā)現(xiàn)又三人認(rèn)識(shí)墜落的男子，在搜查之后啤酒的泡沫、咖啡的熱氣和未燃完的香煙成為了三人不在場(chǎng)證明的證據(jù)。

為了補(bǔ)償先前被卷入鈴木號(hào)特快車(chē)內(nèi)發(fā)生的恐怖事件，園子邀請(qǐng)毛利一家和柯南前往度假，而暴露身份的波本竟然以網(wǎng)球特別教練的身份也出現(xiàn)在那里，被球拍砸到的柯南不幸受傷，簡(jiǎn)單的治療之后他被帶到附近網(wǎng)球社成員的別墅休息，當(dāng)他醒來(lái)時(shí)卻發(fā)現(xiàn)房間里有一具不自然的尸體。

被初音小姐雇傭的偵探安室透在調(diào)查伴場(chǎng)先生時(shí)發(fā)現(xiàn)了一件事，初音小姐和伴場(chǎng)先生都是從同一間飯店獲救的嬰兒，兩人都是在身份不明的情況下在同一所教會(huì)中撫養(yǎng)長(zhǎng)大，聽(tīng)到這些之后的初音非常在意。所有的證據(jù)都指向了伴場(chǎng)先生，在車(chē)底找到初音小姐掉落指甲的柯南似乎看出了事情的真相，這背后或許有著令人悲傷的事實(shí)。