紀(jì)曉嵐欲將揭露云州貪案詳情的帳冊請皇上過目，不想被警惕性極高的小月發(fā)現(xiàn)。無奈之余，靠口技迷惑守衛(wèi)，幫助皇上與一逃離了禁錮。 云州知府吳大人求見皇叔十四王爺及其愛妃四姑娘，大加挑唆利誘。此二人早有覬覦皇位之野心，此番得知皇上落難，不免蠢蠢欲動，欲借刀殺人，從而東山再起。 云州府衙被人縱火，莫愁誤以為關(guān)在府衙牢獄中的同黨黃克明遇害，大為悲痛，負(fù)氣要殺紀(jì)曉嵐報復(fù)。幸紀(jì)曉嵐有過目不忘之才能，允諾可將已被毀的帳冊毫厘不差地復(fù)寫出。恢復(fù)自由的皇上決心不惜任何代價解救出這位足智多謀的名士，雙方正欲交換人質(zhì)時，黃克明卻被一支毒箭身中身亡。紀(jì)曉嵐再次倫為莫愁、小月等人的階下囚。朝夕相處中，他的橫絕于世的才華與嫉惡如仇的品格逐漸感染了兩位行俠仗義的女子。 和福康安陪同驚魂未定的皇上看戲解憂，十四王爺、四姑娘亦悄悄躲在角落，虎視眈眈，趁人不備，四姑娘回茶中投毒。

和珅知道紙里包不住火，于是將齊蘇圖的贈銀封好，以便日后上繳以示清白。乾隆暗示銀妃要堅決查辦齊家，銀妃佯裝大義滅親，以死來表示自己不愿讓乾隆為私情所累，乾隆深受感動，表示不再追究齊家。太后此時也出面對銀妃予以袒護(hù)。劉全跟蹤紀(jì)曉嵐找到工匠住處。瘋癲的洪仁趁眾人不備跑出院子，被劉全劫持。紀(jì)曉嵐無意中發(fā)現(xiàn)了古大力挖的暗道。和珅惟恐自己被連累其中，于是讓劉全將工匠的藏身之處透露給齊家，再制造洪仁瘋癲之中縱火的假象以害死洪仁。小月夜闖皇宮，讓乾隆秉公執(zhí)法，查辦齊家，乾隆卻表示礙于親情，無能為力。紀(jì)曉嵐再次披露齊家貪贓枉法的罪行，乾隆大怒。齊蘇圖趁紀(jì)曉嵐去給工匠送飯之機(jī)，將房子點燃。紀(jì)曉嵐等人猶如甕中之鱉。

乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產(chǎn)生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀(jì)曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀(jì)曉嵐仔細(xì)看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫(yī)為如玉療傷，卻發(fā)現(xiàn)如玉實為女兒身。得知紀(jì)曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀(jì)曉嵐。紀(jì)曉嵐苦口婆心規(guī)勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀(jì)曉嵐《四庫全書》總纂官的職務(wù)，和珅幸災(zāi)樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關(guān)。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學(xué)，被乾隆指派到四庫館修書。

齊蘇圖對大夫洪仁軟硬兼施，得到了一劑可以使人致瘋的藥方。齊蘇圖讓牢頭將藥放到雞湯里。紀(jì)曉嵐用散銀試出湯里有毒。為了麻痹對方，紀(jì)曉嵐假裝將湯喝下。小月在和珅手下的胡亂指示下，找遍了每個地方卻一無所獲。銀妃懇請乾隆嚴(yán)查齊家暴尸一案，乾隆應(yīng)允。紀(jì)曉嵐無意中得知湯里的藥會使人致瘋，于是將計就計，開始裝瘋。小月發(fā)現(xiàn)了一直跟梢的劉全，知道其中有鬼。小月要進(jìn)宮面圣，和珅忙加以阻攔。這時劉全來報，聽說紀(jì)曉嵐瘋了，和珅立刻變得有恃無恐起來。得知紀(jì)曉嵐失蹤，乾隆決定查個究竟。乾隆設(shè)計假裝巧遇和珅和小月，然后提出要調(diào)查吏治，誰先進(jìn)牢誰贏。和珅大鬧集市，誰知官差視而不見。乾隆假裝要殺小月，官差卻見死不救。三人使盡渾身解數(shù)，終于同時入了獄，監(jiān)獄里發(fā)現(xiàn)了瘋瘋癲癲的紀(jì)曉嵐，乾隆和小月見狀痛心疾首。乾隆怒斥順天府尹玩忽職守，將其革職查辦。紀(jì)曉嵐在大殿之上裝瘋賣傻，把和珅和齊蘇圖一頓臭罵，透露了很多隱情。

為避免和珅從中舞弊，紀(jì)曉嵐自薦調(diào)查此事。紀(jì)曉嵐推薦不畏權(quán)勢的海升進(jìn)行調(diào)查。和珅讓劉三盡快將煤窯脫手，劉三似有難言之隱。小月假扮皇室之人，與海升進(jìn)山察探，表示要買下煤窯并約劉三在酒樓詳談。劉三得知后暗自慶幸，迫不及待地前去和海升商談買賣煤窯之事，被早已等候于此的紀(jì)曉嵐捉拿歸案。和珅表示自己查出劉三是開窯之人，并要求紀(jì)曉嵐從嚴(yán)查處，以示自己秉公執(zhí)法。眾人規(guī)勸海升看在和珅的面上放過劉三，以給自己留后路，海升堅持要秉公處理，和珅擔(dān)心劉三供出真正的幕后主使而連累自己，于是命劉三服毒自盡。海升欲繼續(xù)調(diào)查，卻得知劉三已死并被家人拉回老家埋葬。