就在柯南和服部調(diào)查時，小蘭與和葉又親眼目睹了一起命案的發(fā)生，死者是旅行團中的片桐，服部剛想要仔細(xì)調(diào)查，就被自己的老爸教訓(xùn)一番，可這反而激起了服部想要調(diào)查真相的欲望，柯南和服部根據(jù)手頭的線索和嫌疑人的供詞，推斷出了兇手，于是兩人暗中尾隨糟屋到一個破舊的工廠，然而螳螂捕蟬黃雀在后，柯南被不明人士挾持，這些人到底是誰？服部能順利找到兇手嗎？

看著奄奄一息的柯南，步美建議大家自己想辦法，三人按照石頭上的文字推斷出了出口方位又利用蝙蝠逃出了洞穴，歹徒也遭到逮捕。緊接著柯南被立刻送到醫(yī)院進行治療，又在小蘭碰巧知道血型的情況下給他輸了血，小蘭最近的奇怪反應(yīng)讓柯南意識到自己的身份或許已經(jīng)在小蘭面前暴露，就在他打算向小蘭坦白時，灰原拿槍對準(zhǔn)柯南。

小五郎等人在去海豚樂園的路上，遇到了幾位正在進行大學(xué)同學(xué)聚會的女子。為了接另一位大學(xué)同學(xué)，他們一起前往海豚樂園飯店卻意外發(fā)現(xiàn)她們等待已久的藤村直美被殺害了。經(jīng)過調(diào)查之后柯南確認(rèn)了兇手的身份并向大家演示了兇手利用雪糕的犯罪手法。再自己留下的證據(jù)面前，兇手最終承認(rèn)了罪行。

小蘭發(fā)現(xiàn)“影秋村”的村長船木也被殺害。柯南發(fā)現(xiàn)矢部賬戶每月固定打入的匯款，在詢問了駒井關(guān)于7年的事故之后確定了這次的殺人事件與七年前BONNET公交車發(fā)生的事故有關(guān)。在拜托教授調(diào)查了事故之后柯南發(fā)現(xiàn)兇手的身份并發(fā)現(xiàn)兇手欲重演悲劇，他獨自登上觀光車與犯人對峙阻止了悲劇的發(fā)生。

為陪園子買東西，柯南和小蘭來到一家百貨公司，可小五郎卻莫名奇妙的被牽扯進目暮警官等人為引誘歹徒現(xiàn)身而設(shè)下的圈套，之后，目暮警官表示他們正在調(diào)查一起連續(xù)的毆打婦女案，柯南在這些受害人的照片中發(fā)現(xiàn)她們都是這家百貨公司客人的這一共同點，這時，小蘭卻在百貨公司的地下停車場發(fā)現(xiàn)了一名女性的尸體，雖然目暮警官立刻進行辦案，但柯南卻發(fā)現(xiàn)他與平常有所不同。