從火災(zāi)現(xiàn)場(chǎng)逃出來的柯南等人看到的是跪坐在地上的初穗，想要?dú)⒑︷^長(zhǎng)的三人卻反被殺害，而初穗承認(rèn)自己失手將想要對(duì)館長(zhǎng)下手的姐姐殺死，看到現(xiàn)場(chǎng)遺留的物品后柯南有了線索，這并不是一起單純的正當(dāng)防衛(wèi)，在這個(gè)事件的背后還隱藏著不為人知的真相，隱藏在能面背后的真正兇手到底是誰(shuí)？

高木警官完全沒有向任何人告知行蹤便獨(dú)自出了遠(yuǎn)門，在警視廳門前等待高木警官的少年偵探團(tuán)們遲遲等不來人，這時(shí)一個(gè)男人交給了他們一個(gè)說是高木警官送來的包裹。佐藤警官打開包裹后發(fā)現(xiàn)里面放著一個(gè)平板電腦，按下電源后看到的竟然是身處于危險(xiǎn)之中的高木警官，即便高木警官還保持著冷靜，但體力透支的他還能撐多久？

看似自殺的案件還存在著很多疑點(diǎn)，現(xiàn)場(chǎng)留下的物件和快速轉(zhuǎn)臺(tái)的情況讓柯南明白了作案手法，而能夠作為決定性證據(jù)的物品還藏在真正的兇手身上。奶奶受到的訊息讓恩田的謊言不攻自破，而作為冒牌小五郎的他正處于尷尬的境地，察覺到背后隱情的柯南并不準(zhǔn)備揭穿他，柯南還準(zhǔn)備讓這個(gè)冒牌的小五郎展現(xiàn)名推理指出真正的兇手。

經(jīng)過不斷的調(diào)查，柯南和平次終于知道了這起事件的始末，而小光這時(shí)又收到了來自洋房主人的簡(jiǎn)訊。假冒小光的合葉在小蘭的幫助下一同打倒了埋伏在南蠻房間里的兇手，敗露了行動(dòng)的兇手趁著昏暗的光線從暗道逃跑，被卡在暗道出口的他遇到的是平次和柯南，而兇手在燈光下顯現(xiàn)出來的臉是……

為了完成寫生作業(yè)的少年偵探團(tuán)來到了米花市的郊外，在那里他們看到了草叢上的UFO，而這與一起殺人事件有著關(guān)聯(lián)。正當(dāng)柯南等人詢問高木警官時(shí)UFO的主人小沼博士出現(xiàn)了，在調(diào)查研究所時(shí)發(fā)現(xiàn)了死者和自己要好的大哥萬年先生都為大藏工作，小沼先生正好買了大藏的字畫，而身藏巨款的大藏臨死之前告訴死者和萬年的訊息便是UFO。