警方對(duì)酒廠的所有人一一進(jìn)行偵訊后，卻并沒有發(fā)現(xiàn)時(shí)什么異常，但柯南卻提出了兩個(gè)疑點(diǎn)，即兇手為什么要把尸體搬走，又為什么在兩天之后暗中告訴警方尸體的位置。為了思考這兩個(gè)問(wèn)題，柯南想破了腦袋，直到他從換班休息的酒廠老員工哲田那里得知了以前的事情，隨后他冒充小五郎打電話給警方，讓他們調(diào)查一件事情，結(jié)果正好證實(shí)了他的想法，兇手一定就是那個(gè)人！

在案件調(diào)查過(guò)程中小蘭對(duì)柯南的身份起疑，于是，她緊盯柯南的一舉一動(dòng)，就在她向新一的手機(jī)發(fā)送信息想要證實(shí)自己的想法時(shí)，狩谷家的門鈴再次響起，可門口卻沒有人，仆人說(shuō)這種惡作劇時(shí)常發(fā)生。之后，警方又對(duì)家中的三個(gè)嫌疑人進(jìn)行偵訊，并在柯南的引導(dǎo)下推理出了事情的真相，沒想到兇手竟然與12年前的案件有關(guān)聯(lián)。

柯南和元太等人在外玩耍時(shí)，遇到了三個(gè)對(duì)蜘蛛很有研究的人，于是大家興致勃勃的觀看浦崎所飼養(yǎng)的毒蜘蛛，這時(shí)，系川打電話給新野教授，可對(duì)面卻傳來(lái)一聲慘叫。待大家到達(dá)研究所時(shí)，教授已經(jīng)身亡，雖然柯南在現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了毒蜘蛛，卻并沒有找到相應(yīng)的血清，并且他還發(fā)現(xiàn)有人對(duì)電話動(dòng)了手腳，由此判斷教授并非死于意外，這是一起謀殺案件，與教授相識(shí)的這三名蜘蛛愛好者都有殺人的動(dòng)機(jī)，兇手一定就在他們之中。

搞笑藝人廣松晨跑的時(shí)候發(fā)現(xiàn)了一具尸體，驚慌失措的他便匆忙報(bào)警，不想他這個(gè)第一發(fā)現(xiàn)者卻成了最大的嫌疑犯，因?yàn)槭w擺出的剪刀手正好與廣松的藝名一樣，高木警官了解案情之后，認(rèn)為自己的朋友絕對(duì)不會(huì)殺人。另一方面，柯南從死者的朋友那里得知了一些關(guān)鍵信息，于是在他的引導(dǎo)下，一心想要幫朋友洗清冤屈的高木警官推理出了這個(gè)讓人心酸的真相。

柯南和服部必須在第九局下半場(chǎng)前解開暗號(hào)，可是時(shí)間已經(jīng)不多，這個(gè)空白暗號(hào)到底代表著什么，這時(shí)，柯南靈光一現(xiàn)想起了看臺(tái)上所缺少的17和22號(hào)門，但情況危急，必須爭(zhēng)分奪秒，之后服部和柯南推斷出了暗號(hào)所指的位子，沒到竟然就在小蘭她們附近，三人緊忙跑去，果然找到了第三支手機(jī)，根據(jù)手機(jī)上的數(shù)字，柯南很容易就找到了這個(gè)甲子園惡魔的位置，而他又有什么樣的苦衷？