和珅讓徐有慶根據從乾隆那里抄來的要點擬題，徐有慶表示為了錦繡前程，愿意為和珅效勞。和琳提醒和珅要提防徐有慶，和珅不以為然。紀曉嵐對徐有慶的判若兩人感到不解，決定一探究竟。趙新進由于幫助紀曉嵐調查舞弊之事，遭到奸人陷害而變瘋。趙青表示要替哥哥參加會試。她認為哥哥的名字出現在榜首時，他的病情就會好轉。紀曉嵐苦口婆心地告誡趙青替考也是舞弊露，趙青不為所動，并再度不辭而別。徐有慶告訴紀曉嵐自己在施苦肉計，只為了得到更多和珅的舞弊證據。和珅與和琳從徐有慶的話語中發現了破綻，決定將其滅口，以防后患。紀曉嵐暗示乾隆試題被泄露。王喜知道難逃一死，便服毒自盡，臨死前誣陷紀曉嵐為幕后主使。紀曉嵐意識到徐有慶要遭不測，貼告示尋找徐有慶。臨考前，和珅貌似悠閑地購買了一大批鴿子。鑒于上一次的經驗教訓，乾隆將此次會試的搜撿設置得更加嚴格。

紀曉嵐夜讀時又接到被扔進窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀曉嵐夜探郭天，得到通報的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機救出瑤琴。紀曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調查國庫虧空一案。紀曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災為由取得真賬本。和珅模不透紀曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動身時救出瑤琴。

乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀曉嵐仔細看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫為如玉療傷，卻發現如玉實為女兒身。得知紀曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀曉嵐。紀曉嵐苦口婆心規勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀曉嵐《四庫全書》總纂官的職務，和珅幸災樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學，被乾隆指派到四庫館修書。

貴寧別有用心地將小月的真實身份告訴紐氏，紐氏懷疑海升與小月有染。紀曉嵐提醒海升防備和珅，并泄漏了小月的真實身份。海升聞言愕然。紐氏勸海升歸順和珅，遭到海升的斷然拒絕。紐氏佯裝上吊，卻不知貴寧暗中將上吊繩系成死扣，于是一命嗚呼。貴寧借機大鬧靈堂，指出紐氏是被海升謀害致死。步軍統領衙門經過尸檢確認紐氏為自縊身亡，貴寧不服。和珅讓貴寧咬定紐氏是他殺，并讓女婿綿慶以繼承皇位為餌拉攏步軍統領衙門總督綿思。綿恩同意將此案轉給刑部復檢。刑部復檢的結果與初檢結果如出一轍，貴寧仍不予認可。和珅表示一切均在自己掌握之中，指使貴寧告御狀，誣蔑驗尸官為迎合紀曉嵐而謊報案情。

小芳自首，表示自己殺死了姐姐。紀曉嵐責怪小月擅自將海升之事告訴小芳，將事態嚴重化。貴寧、賈三光天化日要劫走香兒，香兒在廝打中不慎撞死。當聽說逃走的打手是長了四指的任五，紀曉嵐豁然開朗。得知小芳就是昔日選秀時大鬧順貞門的人，乾隆派紀曉嵐和綿恩重審小芳。小芳公堂之上自欖罪責，紀曉嵐讓海升與其對質，海升與小芳爭相認罪，紀曉嵐與和珅陪乾隆去戒臺寺。方丈受紀曉嵐委托。將李二原本為一村夫野漢，卻因得到官宦輔佐而搖身一變成為活佛的真相告知乾隆。紀曉嵐發現任五藏匿在此。在豆腐坊無意中得知黃豆受潮發芽的力量足以頂動石頭而得出佛像破土而出是因為土中埋有黃豆的結論后，紀曉嵐找到綿恩，讓其派兵捉拿李二以及任五。