金澤氏由于被迷樣的狙擊者所威脅，委托小五郎調查。小五郎等人到了建筑師金澤氏的別墅。大家在巴比0時突然聽到槍聲，循聲去看時金澤氏已經被殺害。毛利和警官發(fā)現了兇手殺人的機關推測犯人可能是外部人員但在柯南的調查下發(fā)現了兇手就是在島上的內部人員。在罪證面前兇手最終承認了罪行同時道出了因為金澤偷盜自己設計而最終走上不歸路的事情。

打算盜取鈴木財閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜基德，想起了以前關于鐘臺的一個事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事務所里收到一封附有支票的不明發(fā)信人的信函，并且在其上方還有一行奇怪的話語。

警方從案件相關人的口中得知，一年前被害者曾在這個停車場撞死過一個小男孩，之所以出現車禍就是因為當時被害者穿著厚底鞋而無法及時剎車，一番追查后，柯南發(fā)現兇手就是……與此同時，只身在百貨公司內的園子遭到了兇手追殺，在黑暗的百貨大樓里很難鎖定園子的位置，危機時候，目暮警官及時出現擋住了兇手的襲擊，但他卻因此受傷。數日后，大家一起去醫(yī)院看望目暮警官時，從松本那里得知了目暮警官的秘密。

霧之峰賓館的主人寺院晚上開車出去兜風，第二天在停車場發(fā)現坐在車子里的寺院已經死了。在調查的過程中發(fā)現每個人和寺院似乎都有過節(jié)?？履习l(fā)現車罩上裂痕的疑點，而停車場看守的證詞又增加了疑團。最終柯南發(fā)現了犯人的犯罪手法并當場演示給眾人，而殘留的焦油也暴露了兇手的身份。

少年偵探團在放學的途中發(fā)現勾在S形鉤子上的結婚戒指。光彥說這是某個人的SOS的求救信號，少年偵探團的成員們開始搜索現場正在建的公寓。雖然中途誤會了島明夫婦，但是在大家的搜查下，柯南最終發(fā)現戒指的真真含義和“上原美里”的疑點。獨自面對犯人的柯南再次使用麻醉針逃離危險并救出被囚禁的上原美里。