柯南離開(kāi)時(shí)雖交代元太他們把追蹤眼鏡交給警方，但想要立功的偵探團(tuán)卻私自行動(dòng)，并利用眼鏡找到柯南的位置，正要打電話報(bào)警的時(shí)候被歹徒發(fā)現(xiàn)。眼看就能將TWO-MIX解救，柯南卻因元太等人的綁架，再度落入敵人手中，他戳穿歹徒想要練習(xí)帶的目的后，歹徒惱羞成怒點(diǎn)燃屋內(nèi)的汽油，柯南等人能否成功逃脫？

米花博物館將要舉辦珠寶展，園子家的「黑暗星辰」也要參展，可在此之前，園子家收到了一封來(lái)自怪盜基德的盜取通知信，柯南解開(kāi)通知信的暗號(hào)后來(lái)到杯戶市立飯店屋頂，基德在月色中憑空到來(lái)，將警方內(nèi)部搞的一團(tuán)糟后，順利逃跑，并留下通知信說(shuō)他定會(huì)盜走「黑暗星辰」。宴會(huì)當(dāng)天，園子的母親給上船的每個(gè)人都發(fā)了一顆黑珍珠，混淆視聽(tīng)，可基德手法更高一籌，他偽裝成了鈴木會(huì)長(zhǎng)登上船只。

柯南在朋友們?nèi)D書館做讀書報(bào)告時(shí)，警察突然來(lái)詢問(wèn)圖書館職員玉田失蹤一事，館長(zhǎng)津川表示自己也不清楚，警察做了簡(jiǎn)單的搜尋后離開(kāi)。但少年偵探團(tuán)留到夜晚做深入調(diào)查，期間館長(zhǎng)曾鬼鬼祟祟的來(lái)過(guò)一次，等他離開(kāi)后，大家發(fā)現(xiàn)館長(zhǎng)在利用圖書館進(jìn)行販毒交易，當(dāng)他們找到被館長(zhǎng)殺害的玉田的尸體時(shí)，沒(méi)想到館長(zhǎng)也發(fā)現(xiàn)了他們，少年偵探團(tuán)能否順利脫險(xiǎn)？

小五郎應(yīng)畫家花岡之邀前來(lái)談話，可是等了許久仍沒(méi)見(jiàn)到花岡的身影，就在小五郎生氣要離開(kāi)時(shí)花岡出現(xiàn)，與此同時(shí)，另一位住在對(duì)面的女插畫家蝶野打來(lái)電話說(shuō)要自殺，柯南等人親眼看到蝶野從樓下墜落，趕到現(xiàn)場(chǎng)時(shí)蝶野已死，而這個(gè)看似自殺的案件其實(shí)是他人謀殺，兇手就是花岡，可蝶野從樓上跳下時(shí)，花岡正和大家在一起，他到底是怎么做到的？

柯南和步美他們一起玩捉迷藏的游戲，步美躲在一輛車的后車廂中，沒(méi)想到竟然睡著。元太一直都找不到步美，最后柯南終于用無(wú)線電和她聯(lián)絡(luò)上了步美，但步美卻在車的后備箱中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)人頭！剛好此時(shí)有件連續(xù)綁架少女殺人事件，柯南懷疑那輛車的兩個(gè)男人就是那個(gè)事件的歹徒。為了救出步美柯南通過(guò)步美的描述利用滑板開(kāi)始追蹤步美。最終柯南成功追上了步美但所謂的連續(xù)殺人犯卻是誤會(huì)一場(chǎng)。