少年偵探團(tuán)在公園看到了可疑的男人。他們知道那個(gè)男人是為了向綁架燕秋夫的犯人交贖金的之后，來(lái)到了燕宅。原來(lái)燕財(cái)閥的孫子秋夫被人綁架了。在看了秋夫的畫(huà)之后柯南發(fā)現(xiàn)秋夫有留下畫(huà)畫(huà)地方特征的習(xí)慣，尋找秋夫畫(huà)里留下的訊息成了關(guān)鍵所在。在少年偵探團(tuán)的各位的齊心協(xié)力下終于找到綁架秋夫的嫌疑犯的地方并成功救出了秋夫。

茂木認(rèn)為小五郎是兇手而開(kāi)槍將他射傷，當(dāng)前來(lái)“黃昏別館”的所有名偵探都命喪黃泉時(shí)，電腦上居然出現(xiàn)了一行關(guān)于寶藏的信息，一直躲在監(jiān)視器操控室的神秘幕后黑手終于按捺不住露出了真面目，沒(méi)想到這個(gè)人居然是……柯南引導(dǎo)她說(shuō)出了整件事的真相，而這時(shí)，本應(yīng)死去的偵探們居然都出現(xiàn)在門(mén)口，可到底是怎么回事？這棟別墅的寶藏又是什么？

返回旅店后，小五郎立馬給警方打電話，可是雪崩將隧道掩埋，警方無(wú)法及時(shí)趕來(lái)，因此旅店里的所有人都參與到了推理當(dāng)中，店里有旅客說(shuō)自己曾在樹(shù)林里看到了一個(gè)頭戴針織帽的可疑男子，之后，實(shí)果從二垣的相機(jī)中洗出了一張帶有黑影的照片，大家又一起觀看了二垣死亡前一天所拍的視頻，卻并未發(fā)現(xiàn)任何古怪，這時(shí)，柯南注意到了旅店里的小狗三郎并從它的身上發(fā)現(xiàn)了線索。

為找尋更多的線索，服部向胴口詢問(wèn)起袴田與垂見(jiàn)之間的恩怨，不想他卻避而不答反而找來(lái)袴田教訓(xùn)服部，之后他又遇到了當(dāng)時(shí)在二館外的學(xué)生，據(jù)目擊人說(shuō)所，案發(fā)時(shí)他們?cè)吹揭粋€(gè)頭戴面具，身背護(hù)具袋的人進(jìn)出這里，聽(tīng)到這些證詞之后，服部終于知道了兇手是誰(shuí)以及他所使用的手法，而此時(shí)，柯南等人也趕到了比賽會(huì)場(chǎng)，聽(tīng)了警察對(duì)案情的描述之后，柯南急忙趕往服部所在的二館倉(cāng)庫(kù)，卻發(fā)現(xiàn)服部早已將兇手制服。

柯南一開(kāi)始就知道兇手是誰(shuí)，但他卻苦于找不到證據(jù)，然而當(dāng)他無(wú)意間看到勒在素夫脖子上的領(lǐng)帶，沒(méi)錯(cuò)，證據(jù)就是這個(gè)！另一邊，目暮警官發(fā)現(xiàn)素夫死前所買(mǎi)保險(xiǎn)的受益人是菊代，而且在素夫消失的這段時(shí)間她也曾來(lái)過(guò)倉(cāng)庫(kù)以及根據(jù)美濃所提供的證詞，這一切線索不得不讓警方懷疑殺死素夫的兇手就是菊代，而菊代也是百口莫辯。這時(shí)，柯南將園子麻醉，借助變聲器將事情的真相一一道出！