這天，米小圈和其他隊員一起做野外拉練鍛煉體能，看著其他隊員跑得氣喘吁吁，米小圈又開始耍起小聰明，他繞了道悄悄躲在一棵樹下看小說，休息，終于聽到吹哨的聲音，他才匆匆爬起來，臨走時還不忘將手里的礦泉水往臉上噴噴當做汗水，米小圈做這些游刃有余，當他和其他隊員一起“大汗淋漓”地跑回操場，隊長不明就里還表揚他能夠堅持。看到隊長翻開隊員們號碼牌后面記錄的公里數，米小圈開始懵逼了，很快隊長看到米小圈只跑了三百步，當著隊員的面毫不客氣地指責米小圈投機取巧，米小圈根本不服氣，他認為既然是鍛煉體能，平時應該多節省，等上比賽現場在揮汗如雨也不遲，大伙紛紛側臉，米小圈覺得自己根本沒錯。果真，不久之后，他們與春華小學的對戰就開始了，米小圈躍躍欲試，肌肉老師卻讓他有耐心，準備讓米小圈在最后下半場進入，并且當做隊里的黑馬，米小圈聽到肌肉老師如此重用他，心里非常得意。上半場春華小學以一比零的得分勝出，經過短暫的休息調整后，秋實曉學的運動員開始展現出優勢，因為他們平時比較重注體能訓練，因此在后半場比賽中依然保持著雄厚的實力，眼看就要與春華小學的分數追平，可是五號運動員卻因為不小心足鍵手上受傷，終于被擔架抬下陣來。米小圈

小蘭和園子聊著幼稚園時的往事，新一當時所做出的櫻花名牌推理，正是他的第一次推理，而在小蘭不知道的情況下新一一直在背后默默地守護著她。櫻花班班主任江舟論介看小蘭的眼神讓新一非常在意，他認為這個老師是故意想要和小蘭親近，他所作出的解釋看似合理，但新一依舊無法放松警惕，新一的父親工藤優作得知后也展開了調查。

柯南所在的班里來了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發現石灰已經用完了。柯南告訴若狹老師舊倉庫里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說舊倉庫有幽靈出沒，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團一同前往舊倉庫。在尋找石灰的過程中，柯南發現一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發現了一具骸骨……

建太去撿球時透過窗戶發現了一個人身受重傷靠在沙發上，待大家發現后檢查傷者已經死亡。柯南不認為這是起意外事件，因為客廳里還躺著另外一名死者。經警察調查后得知受傷死者是房地產老板河合信藏，躺在地上的死者是河合以前的員工名叫柴田健介。柴田因挪用公款被河合開除，警察推測這可能是柴田的殺人動機。事件發生時河合的妻子優子正在家中二樓睡覺，沒有聽到樓下的打斗聲，這件事讓柯南起了疑心。

警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴男躲在一個倉庫里，不知為何柯南與小五郎也在場。警方突破倉庫門進入準備抓捕嫌疑人時，鷹取嚴男打開事先設下的陷阱，趁現場混亂之時綁架了柯南當做人質逃跑。柯南在犯人車上伺機逃跑，不料卻跑進死胡同里被抓。無奈之下柯南被帶到了一個荒廢的倉庫里，犯人鷹取嚴男究竟想讓柯南做些什么？