七年前載滿相當(dāng)于十億日元金子的竜神號(hào)，突然出現(xiàn)在敷島海面。以幽靈船為噱頭的村長三上邀請小五郎來演講，而他的真正目的是拜托小五郎找到金子的所在。演講時(shí)，小五郎差點(diǎn)喪命講臺(tái)，兇手很有可能是島上的守衛(wèi)浜田，和旅行社職員上原，兩人也似乎是舊識(shí)。當(dāng)晚小五郎一路追蹤襲擊他的武士，卻被人打暈掉入了兇手的陷阱，成了殺害浜田的兇手。

放學(xué)后，光彥一伙兒聚在一起研究寬波段接受器時(shí)，無意中接聽到了一個(gè)綁架恐嚇電話，大家都很擔(dān)心這個(gè)被綁架的女孩性命，便決定根據(jù)這通電話找到女孩，柯南根據(jù)歹徒陸續(xù)打給女孩爸爸的電話，和伙伴們一步步找到了被害人和歹徒的位置，成功解救人質(zhì)。

阿笠博士送給柯南一幅追蹤犯人眼鏡，柯南本想把發(fā)信器粘在小蘭身上，卻陰錯(cuò)陽差的粘在了來偵探事務(wù)所找爸爸的雅美手表上，根據(jù)女孩提供的信息柯南在賽馬場找到了女孩的爸爸健三，事情本應(yīng)就此結(jié)束，可第二天傳來的卻是健三的死訊，擔(dān)心雅美有危險(xiǎn)，柯南利用追蹤器找到了一個(gè)高大的男人并非雅美，從柯南另一個(gè)參與此事的偵探口中得知此事并非尋人那么簡單，深入調(diào)查過程中，又出現(xiàn)了一樁命案。

毛利小五郎受古董收藏家丸傳次郎之托，調(diào)查他太太丸稻子是否有外遇。結(jié)果遇到傳次郎有客人來拜訪。但是兩三個(gè)小時(shí)過去后仍然不見傳次郎的蹤影，在進(jìn)入的房間后發(fā)現(xiàn)傳次郎已經(jīng)被殺害！而房間的墻壁上也不滿了劍痕。經(jīng)過調(diào)查后犯罪嫌疑人鎖定在了在小五郎之前來拜訪傳次郎的客人中。最終通過勘察現(xiàn)場柯南發(fā)現(xiàn)了死者留下了死亡訊息并最終找出了犯人。

看到防盜鎖上膠帶的痕跡，又通過試驗(yàn)證實(shí)自己的推測，柯南輕松破解密室難題。在調(diào)查過程中，柯南在銅像附近找到了自己掉落的鋼筆，他注意到酒店下的風(fēng)，詢問得知這叫「公主風(fēng)」，將「公主風(fēng)」和其他七位旅客的房間位置結(jié)合，柯南斷定兇手就是那個(gè)人，這時(shí)，小蘭急匆匆跑來說找到可以洗清前田嫌疑的證據(jù)，柯南利用小五郎展開了一場精彩的推理和實(shí)驗(yàn)。