為了紀(jì)念戰(zhàn)國(guó)武將信長(zhǎng)入主岐阜城450周年，偵探少年團(tuán)和阿笠博士來(lái)到岐阜市內(nèi)游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當(dāng)?shù)氐挠⑿坌惚硌荨１硌萁Y(jié)束后，光彥因想得到簽名而獨(dú)自返回觀看場(chǎng)所，然而他卻在尋找表演人員的過(guò)程中遭到綁架……與此同時(shí)，在博物館展出的信長(zhǎng)公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

一天，李黎給米小圈出了一道腦筋急轉(zhuǎn)彎，一道題里面有十個(gè)大爺，問(wèn)哪個(gè)大爺偷了錢，米小圈正絞盡腦汁想到底哪個(gè)大爺偷走了錢，還讓同學(xué)們紛紛出來(lái)情景演繹，就在這個(gè)時(shí)候，班級(jí)里忽然來(lái)了不速之客，對(duì)方小小的個(gè)字，說(shuō)話卻非常苛刻，并且對(duì)同學(xué)滿臉不屑，米小圈對(duì)這個(gè)不懂禮貌的小屁孩非常反感，就在這個(gè)時(shí)候班主任魏老師來(lái)了，給班上的同學(xué)介紹，這時(shí)他們班新傳來(lái)的學(xué)生王聰聰。聽(tīng)說(shuō)這個(gè)王聰聰總是跳級(jí)，從一年級(jí)直接跳到三年級(jí)，貌似天資異稟，智能超強(qiáng)，米小圈才對(duì)此不感冒，沒(méi)過(guò)幾天，語(yǔ)文老師提到民間習(xí)俗對(duì)對(duì)聯(lián)，米小圈本來(lái)對(duì)自己的對(duì)子特別自信，可是王聰聰話音一轉(zhuǎn)，直接成了公然嘲諷，同學(xué)們立刻哄堂大笑。米小圈也有了新的綽號(hào)“方大方”，米小圈對(duì)新來(lái)的同學(xué)恨得咬牙切齒。沒(méi)過(guò)幾天，姜小牙在課間吹噓父親剛剛買了新車，家里又碩大的別墅，這輛新車只是開(kāi)進(jìn)院子就需要半個(gè)小時(shí)。旁邊一直有小朋友發(fā)出驚訝艷羨的感嘆，王聰聰卻笑問(wèn)有一樣?xùn)|西，上可以貼著天，下可以貼著地，問(wèn)這樣?xùn)|西是什么，眾人開(kāi)始迷惑不解，王聰聰抑郁成績(jī)，就是嘴巴。大伙哄然大笑，姜小牙的臉都綠了。米小圈和姜小牙對(duì)王聰聰恨得牙齒癢癢，他們慫恿李黎統(tǒng)一戰(zhàn)線也給王聰聰一點(diǎn)厲害，但王聰聰

小蘭的母親妃英理在自己的事務(wù)所突然被人綁架，但她趁綁匪不注意躲進(jìn)了廢棄的大樓內(nèi)，并用搶來(lái)的手機(jī)向小蘭求救，雖然遭到了綁匪的干擾但柯南還是分辨出來(lái)了妃英理所發(fā)的信息內(nèi)容，從中獲得了一些線索后柯南帶領(lǐng)小蘭和小五郎立刻展開(kāi)救援，但被綁架的地點(diǎn)可能有兩處，柯南能在危急時(shí)刻找到正確的位置嗎？

通過(guò)與世良的接觸，柯南回憶起與世良初次相遇的情形。十年前，秀一從美國(guó)回到日本，與家人一起在海灘游玩，恰好偶遇了年幼的新一和小蘭。沉迷偵探游戲的新一引起了秀一的興趣，正當(dāng)二人交談甚歡時(shí)，突然有一輛車從沿海公路上沖破護(hù)欄墜入深海。秀一馬上潛入海中實(shí)施救援，卻發(fā)現(xiàn)駕駛員已當(dāng)場(chǎng)死亡。根據(jù)秀一的推斷，案發(fā)前車上應(yīng)該還有死者的同伴，而死者的身份也是疑點(diǎn)重重……

柯南等人幫助舊書(shū)店店主裕次郎搬運(yùn)書(shū)籍，并在書(shū)店遇到了裕次郎的兒子一郎。一郎對(duì)于父親經(jīng)營(yíng)舊書(shū)店的事感到很不滿，爭(zhēng)執(zhí)中眾人不歡而散。在光彥的帶領(lǐng)下，柯南等人來(lái)到了舊書(shū)店旁的公園，準(zhǔn)備觀看蒸汽機(jī)車發(fā)動(dòng)的場(chǎng)面，并在等待的途中偶遇了一郎。正當(dāng)眾人與蒸汽機(jī)車合影完畢返回書(shū)店時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)裕次郎被壓在了倒塌的書(shū)架下面……