兇器是房間工具箱里的錘頭，并且柯南還發(fā)現(xiàn)每個(gè)人的房間都有薰衣草和工具箱，到底是誰做出這種安排？又是出于什么目的呢？既然是無人島，那么兇手一定就是這棟房子中的一人，之后柯南他們又對(duì)供電的小房子進(jìn)行了調(diào)查，然而根據(jù)所找的線索，柯南，服部和白馬探每個(gè)人鎖定的嫌犯都不相同，即便如真相也只有一個(gè)！

著名畫家及川武賴四部曲作品當(dāng)中的最后一幅《青嵐》被怪盜基德盯上，柯南、小五郎也因此被請(qǐng)到了及川府，然而那幅畫竟然在設(shè)有監(jiān)視器的畫室里瞬間消失不見，與此同時(shí)，及川的岳父風(fēng)景畫大師神原也被發(fā)現(xiàn)死在這個(gè)房間內(nèi)，難道兇手是從不殺人的基德？之后及川在柯南的后衣口袋中發(fā)現(xiàn)了基德留下的卡片，但柯南一眼就看穿了他的把戲，并推斷出基德就在四名警察之中。

柯南和灰原把撿到的貓還給飼主石上時(shí)，對(duì)面的高利貸事務(wù)所發(fā)生了命案，死者正是事務(wù)所的老板，他的后腦勺因遭到招財(cái)貓的重?fù)舳溃履习l(fā)現(xiàn)吸塵器的集塵袋被人拿走，并且還在沙發(fā)下找到了招財(cái)貓的爪子，警方將出現(xiàn)在現(xiàn)場(chǎng)的村井千佳小姐帶來，一番詢問，村井承認(rèn)了自己的罪行，就在警察準(zhǔn)備帶走犯人時(shí)，柯南將小五郎麻醉道出了這件命案的真兇！

在FBI制定作戰(zhàn)計(jì)劃的同時(shí)黑暗組織就已經(jīng)展開了行動(dòng)，他們以南田陸道的名義寄給FBI一盆花，就在柯南推測(cè)敵人的意圖時(shí)，杯戶中央醫(yī)院突然涌來大波病患，這無疑也是黑暗組織的安排，在處理完花盆里埋的炸彈后，醫(yī)院陸續(xù)出現(xiàn)送貨員，而這些貨物全部都是黑暗組織送的炸彈，如果醫(yī)院爆炸，后果不堪設(shè)想，柯南和赤井秀一又會(huì)采取什么行動(dòng)？

沒過多久，綁匪就打來電話威脅柯南他們盡快找到寶藏，不然難保灰原他們安全。人命關(guān)天，柯南絞盡腦汁想要破解暗號(hào)，他發(fā)現(xiàn)萩市地圖與貓圖相吻合，而貓眼的地方就是線索的所在，于是，他們來到了円政寺，并在這里找到了日記中被撕掉的一頁，柯南將這些零散的圖片拼接成一條路線，大伙兒照此地圖找到了一個(gè)地下山洞，就在寶物將要到手之時(shí)，黑衣人綁匪出現(xiàn)……