不忍看到和葉為解死亡訊息焦急流淚，于是，服部在與柯南的對(duì)話中有意的透露一些提示，所幸和葉一點(diǎn)就通明白了其中的奧秘。另一邊，警方叫來(lái)最先發(fā)現(xiàn)尸體的四人，并一一做了偵訊發(fā)現(xiàn)每個(gè)人都心懷鬼胎有殺人的動(dòng)機(jī)，而柯南和服部也沒(méi)有停止尋找真兇，就在二人找到新的線索時(shí)，和葉突然大呼自己知道誰(shuí)是兇手。

某天，一個(gè)自稱杉森政人的作家找到小林老師，說(shuō)想要采訪少年偵探團(tuán)，得知這個(gè)消息后，元太、步美和光彥三人盛裝打扮，大家在小林老師的帶領(lǐng)下來(lái)到了杉森家，卻發(fā)現(xiàn)他的頭部遭人重?fù)?，已死于家中，警方?jīng)過(guò)調(diào)查將嫌疑人士鎖定于在答錄機(jī)中留言的四人，而在這期間，讓柯南頭大的不止有案情還有一臉疑惑看著柯南推理的小林老師。

在這期間柯南還遇到了茱蒂老師，他將自己竊聽(tīng)到黑衣組織計(jì)劃在IDP的地方殺一個(gè)叫DJ的人的事告訴了她，茱蒂說(shuō)今天下午水無(wú)將采訪三個(gè)首次參加眾議院選舉的人，DJ一定就是其中之一，就在柯南焦頭爛額的推理IDP在哪里時(shí)，茱蒂一句話提醒了他，于是他讓博士驅(qū)車前往杯戶公園，此時(shí)，水無(wú)已經(jīng)開(kāi)始了采訪，柯南和茱蒂火速趕往現(xiàn)場(chǎng)，他們能阻止暗殺事件的發(fā)生嗎？

與黑衣組織的戰(zhàn)斗告一段落，又回到了平靜的生活。某天，少年偵探隊(duì)獲知同樣就讀帝丹小學(xué)的雨宮翔子突然消失，據(jù)說(shuō)她和灰原十分相像，莫非黑衣組織的魔爪已經(jīng)深入學(xué)校？為找到翔子，放學(xué)后大家展開(kāi)了調(diào)查，期間還遇到神色可疑的老師，之后一行人找到了翔子失蹤前來(lái)過(guò)的便利店，并得知她在這里買了飲料、牛奶和小刀片，就在柯南他們百思不得解時(shí)，由美出現(xiàn)……

放學(xué)后，小蘭在鞋柜里發(fā)現(xiàn)了一封情書，正當(dāng)她為此而煩惱時(shí)，遇到了曾在帝丹高中上學(xué)的學(xué)姐，她說(shuō)家里遭到了不明人士的入侵，可奇怪的是小偷不僅沒(méi)偷錢，反而還給她死去的丈夫上了一炷香，并且自己的日記也有被人查看過(guò)的跡象，期間學(xué)姐還談起了高中時(shí)期被自己拒絕過(guò)的男生，看過(guò)照片后，小蘭說(shuō)她今天見(jiàn)過(guò)這個(gè)男生，之后，園子將整個(gè)事件的來(lái)龍去脈推理出來(lái)，這時(shí)，學(xué)姐說(shuō)她還有一件事瞞著大家……