柯南從無人機(jī)上墜落后便失去了犯人的線索，就在眾人一籌莫展的時(shí)候佐藤警官打來電話，她稱發(fā)現(xiàn)了犯人。佐藤警官上前拘捕犯人卻反被挾持，柯南和高木等人趕到后協(xié)力制服了犯人，但手提包內(nèi)的1億日元卻不翼而飛。另一方面，本該被綁架的麻奈美小姐正在美術(shù)館欣賞裕之的作品，而這背后到底是誰在搞鬼？

警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴(yán)男躲在一個(gè)倉(cāng)庫里，不知為何柯南與小五郎也在場(chǎng)。警方突破倉(cāng)庫門進(jìn)入準(zhǔn)備抓捕嫌疑人時(shí)，鷹取嚴(yán)男打開事先設(shè)下的陷阱，趁現(xiàn)場(chǎng)混亂之時(shí)綁架了柯南當(dāng)做人質(zhì)逃跑。柯南在犯人車上伺機(jī)逃跑，不料卻跑進(jìn)死胡同里被抓。無奈之下柯南被帶到了一個(gè)荒廢的倉(cāng)庫里，犯人鷹取嚴(yán)男究竟想讓柯南做些什么？

幫忙繪制屏風(fēng)的少年偵探團(tuán)卷入了殺人案件，通過元太手上的化妝品香味與現(xiàn)場(chǎng)的蛛絲馬跡，柯南斷定兇手就是職業(yè)高爾夫球運(yùn)動(dòng)員伴野貞悟，但他始終沒有找到關(guān)鍵性的證據(jù)，那便是伴野臉上被“兇手”寫下的文字。在屏風(fēng)上酣睡的元太，臉上沾上了老虎紋的顏料，這個(gè)細(xì)節(jié)讓真相浮現(xiàn)了出來。

不久，王聰聰父親來找魏老師要求轉(zhuǎn)學(xué)，還將那本畫有漫畫的書拿給老師看，王聰聰父親覺得秋實(shí)小學(xué)的文化氛圍不行，米小圈和姜小牙以及鐵頭聽到非常驚訝，好不容易建立起來的友誼現(xiàn)在卻要中斷，他們給王聰聰辦了熱烈的歡送會(huì)。一天，米小圈的父親接到一個(gè)電話，是王聰聰父親打來的，兒子被帶回家自學(xué)，將自己關(guān)在書房很多天，不吃不喝，只提出要見米小圈，王聰聰父親趕緊把米小圈叫去，米小圈幾個(gè)鬼臉做完，王聰聰變又樂不可支了。經(jīng)過這件事，王聰聰父親開始反省自己平時(shí)給米小圈的壓力太大，準(zhǔn)備今后帶他經(jīng)常出去玩玩，王聰聰終于肯出門了，平時(shí)在父親的高壓下學(xué)習(xí)，差點(diǎn)造成抑郁。而米小圈的父親覺得自己兒子非常健康，但是去到王聰聰家后，面對(duì)滿墻的獎(jiǎng)狀，他也開始反省，是不是自己“散養(yǎng)”的教育方式才讓米小圈沒有王聰聰優(yōu)秀，從王聰聰家回去，米小圈父親也特意騰出一間房子作書房，滿墻的書籍，滿墻的名人札記，米小圈看了直接嚇得暈倒！這天，米爸開心地宣布他們一家要到新馬泰旅游，米小圈興奮地向全班同學(xué)宣布，終于有吹牛的資本了，再也不被姜小牙比下去，可是萬萬沒有料到，父親訂單的旅游景點(diǎn)是在中國(guó)，并且標(biāo)準(zhǔn)的農(nóng)家樂，只是名字起得如此大氣，米小圈大失所望，

柯南和平次傳來歷史學(xué)家的死訊，眾人陷入恐慌，并認(rèn)為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學(xué)家主動(dòng)要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長(zhǎng)詢問細(xì)節(jié)，院子卻突然再次著火，與此同時(shí)樓上的考古學(xué)家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房?jī)?nèi)，待柯南等人趕到時(shí)已經(jīng)喪命。經(jīng)過一番調(diào)查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。