柯南、小五郎陪園子和小蘭逛街的時(shí)候，在公園的廁所里發(fā)現(xiàn)了一具被不明人士勒斃的女尸，身穿流行哥特蘿莉裝的被害者名叫久瀨，柯南他們之前曾在新宿的咖啡廳與她有過(guò)一面之緣，她當(dāng)時(shí)只在座位上坐了一下什么也沒(méi)點(diǎn)就去了店外的廁所，之后與她約見的朋友莊堂來(lái)到店里，但久瀨卻再也沒(méi)有出現(xiàn)。雖然柯南他們懷疑莊堂就是兇手，但她卻有完美的不在場(chǎng)證明。

大家二次來(lái)到倉(cāng)庫(kù)后發(fā)現(xiàn)了在門上方供奉著的神壇，而讓柯南更為好奇的是神壇對(duì)面的大算盤，這很可能是啟動(dòng)機(jī)關(guān)的鑰匙，仔細(xì)觀察倉(cāng)庫(kù)之后，柯南發(fā)現(xiàn)了其中的蹊蹺，他叫來(lái)警察與他一起根據(jù)灰塵的多少撥動(dòng)算珠，果不其然，天花板漸漸向下移動(dòng)，警察不僅在這里找到了被盜的寶物還抓住了偷盜者，案件結(jié)束后，柯南揪出了那個(gè)一直暗中幫助元太他們的“軍師”，而這個(gè)人正是……

阿笠博士帶柯南他們一起去吃回轉(zhuǎn)壽司的時(shí)候，遇見了一個(gè)讓人反感的客人我妻，他不僅挖苦元太和周遭的客人，而且還與這里的店長(zhǎng)發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)，當(dāng)柯南他們準(zhǔn)備離開這種不愉快的氛圍時(shí)，我妻突然十分痛苦的倒地不起，柯南立刻判斷出他是被人毒殺，有三個(gè)曾與死者有過(guò)節(jié)的人成為了首要懷疑對(duì)象，然而警察并未從他們身上到隱藏的毒藥，兇手到底是誰(shuí)？他又是如何讓我妻拿到沾有毒藥的盤子？

就在所有人驚訝于晶子之死時(shí)，樸之木匆忙跑來(lái)說(shuō)漫畫家比良坂也死在了房間中，于是，小五郎、柯南等人急忙趕到現(xiàn)場(chǎng)，這又是一起密室殺人，詭異的是這個(gè)房間的門口堆滿了被撕碎的小煌小姐的海報(bào)碎片，警方展開調(diào)查并對(duì)別墅里的所有人進(jìn)行偵訊，八川談到了澤南被殺的命案，以及比良坂、澤南和樸之木受到不明人士威脅的事情，難道這與此次的密室殺人案有關(guān)系？澤南死前所留下的死亡訊息又隱藏著什么意義？

柯南被小五郎拜托照顧一個(gè)叫圣誕的兩歲孩子，因?yàn)樗膵寢屖幼罱偸潜徊幻魅耸扛櫍谑切∥謇砂抵羞M(jìn)行保護(hù)，沒(méi)想到在茂子幫清潔公司送衣服是時(shí)候被人綁架，為解救人質(zhì)尋找更多的線索，柯南和圣誕來(lái)到他的家里進(jìn)行調(diào)查，在一片狼藉的屋內(nèi)柯南發(fā)現(xiàn)了鳥的羽毛，這一定是從歹徒身上掉下來(lái)的，之后，他和圣誕一起展開了行動(dòng)，最終柯南找到綁架犯，而這一切竟然是一場(chǎng)無(wú)聲的誤會(huì)！