毛利小五郎受久須美工械廠社長的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉庫抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

這天，米小圈和其他隊(duì)員一起做野外拉練鍛煉體能，看著其他隊(duì)員跑得氣喘吁吁，米小圈又開始耍起小聰明，他繞了道悄悄躲在一棵樹下看小說，休息，終于聽到吹哨的聲音，他才匆匆爬起來，臨走時(shí)還不忘將手里的礦泉水往臉上噴噴當(dāng)做汗水，米小圈做這些游刃有余，當(dāng)他和其他隊(duì)員一起“大汗淋漓”地跑回操場，隊(duì)長不明就里還表揚(yáng)他能夠堅(jiān)持。看到隊(duì)長翻開隊(duì)員們號(hào)碼牌后面記錄的公里數(shù)，米小圈開始懵逼了，很快隊(duì)長看到米小圈只跑了三百步，當(dāng)著隊(duì)員的面毫不客氣地指責(zé)米小圈投機(jī)取巧，米小圈根本不服氣，他認(rèn)為既然是鍛煉體能，平時(shí)應(yīng)該多節(jié)省，等上比賽現(xiàn)場在揮汗如雨也不遲，大伙紛紛側(cè)臉，米小圈覺得自己根本沒錯(cuò)。果真，不久之后，他們與春華小學(xué)的對(duì)戰(zhàn)就開始了，米小圈躍躍欲試，肌肉老師卻讓他有耐心，準(zhǔn)備讓米小圈在最后下半場進(jìn)入，并且當(dāng)做隊(duì)里的黑馬，米小圈聽到肌肉老師如此重用他，心里非常得意。上半場春華小學(xué)以一比零的得分勝出，經(jīng)過短暫的休息調(diào)整后，秋實(shí)曉學(xué)的運(yùn)動(dòng)員開始展現(xiàn)出優(yōu)勢，因?yàn)樗麄兤綍r(shí)比較重注體能訓(xùn)練，因此在后半場比賽中依然保持著雄厚的實(shí)力，眼看就要與春華小學(xué)的分?jǐn)?shù)追平，可是五號(hào)運(yùn)動(dòng)員卻因?yàn)椴恍⌒淖沔I手上受傷，終于被擔(dān)架抬下陣來。米小圈

小五郎帶蘭和柯南來到東京附近的度假山莊放松，在那里遇到了同樣來休閑的女大學(xué)生三人組。小五郎伴著美景喝了許多酒，正當(dāng)他昏昏欲睡之時(shí)，河邊突然出現(xiàn)了異變。河水突然變紅，順?biāo)戮尤挥幸痪呤w飄了過來，小五郎立刻清醒跳河救人，等打撈上來后大家驚覺這居然是剛才的女大學(xué)生之一的秋葉夕子。

少年偵探團(tuán)的理科自由研究作業(yè)是拍攝鎮(zhèn)子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭吵的焦點(diǎn)。爭吵過后岳美負(fù)氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時(shí)候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發(fā)現(xiàn)山下的岳美小姐倒在了血泊中。

小蘭和園子聊著幼稚園時(shí)的往事，新一當(dāng)時(shí)所做出的櫻花名牌推理，正是他的第一次推理，而在小蘭不知道的情況下新一一直在背后默默地守護(hù)著她。櫻花班班主任江舟論介看小蘭的眼神讓新一非常在意，他認(rèn)為這個(gè)老師是故意想要和小蘭親近，他所作出的解釋看似合理，但新一依舊無法放松警惕，新一的父親工藤優(yōu)作得知后也展開了調(diào)查。