小五郎帶柯南和小蘭去露天浴場(chǎng)泡溫泉的時(shí)候，聽到了咔嚓咔嚓的石頭滑落聲，當(dāng)他們尋聲趕到后，發(fā)現(xiàn)不動(dòng)產(chǎn)社長(zhǎng)梅津英章已經(jīng)沒了呼吸，這起看似意外的事件其實(shí)是樁蓄意殺人案，警察對(duì)在場(chǎng)的嫌疑人即死者的女兒麻麗、泰子、秘書八木橋以及浴場(chǎng)老板進(jìn)行偵訊，期間，一條擰干的毛巾從麻麗的包包中掉了出來(lái)，小五郎認(rèn)為這是她為了不留指紋而使用手法，就在他準(zhǔn)備揭穿所謂的兇手時(shí)，知道真相的柯南將他麻醉揪出了真正的兇手！

園子的次郎吉叔祖父要舉辦龍馬展，而怪盜基德則發(fā)出了預(yù)告狀。但奇怪的是這次基德發(fā)出的是歸還物品的預(yù)告狀！而從叔祖父那里園子他們了解到這次次郎吉只是借出了博物館場(chǎng)地，而展覽的主辦發(fā)則是樽見。為了對(duì)抗基德，幾次郎在展覽場(chǎng)地安排了特別“基德歸還處”就在眾人在處處提防怪盜基德的時(shí)候柯南發(fā)覺了基德指定的日期是雨天。但基德的用意究竟何在？

受小林老師之托的少年偵探團(tuán)在視聽教室找防范犯罪錄音帶，這時(shí)，千葉警官突然出現(xiàn)，雖然他嘴上說(shuō)是為了懷念母校，但實(shí)際目的卻是為了找13年前一個(gè)女孩子留給他的情書回復(fù)，詢問(wèn)過(guò)詳細(xì)情況后，大家?guī)退黄鹪诒姸噤浻皫е姓遗⒘粝碌男畔?，最終，柯南找到了女孩的回復(fù)，得知對(duì)方也喜歡自己的千葉，準(zhǔn)備在今晚的同學(xué)會(huì)向這名女生表白，曾經(jīng)錯(cuò)過(guò)這段感情的千葉警官能找到自己的幸福嗎？

妖怪倉(cāng)庫(kù)是把貴重的物品放進(jìn)里面就會(huì)立刻消失的倉(cāng)庫(kù)，少年偵探團(tuán)為了弄清真相決定一探究竟，元太他們?yōu)榱俗尶履下冻鰺o(wú)話可說(shuō)的表情而干勁滿滿。在調(diào)查了倉(cāng)庫(kù)內(nèi)部之后，柯南只看到了地板上留下的零星腳印和嵌在墻上的大算盤，除此之外別無(wú)他物。但從外面的天窗向里面看的話，就能看到堆積如山的寶物，可意外的是當(dāng)再次打開倉(cāng)庫(kù)的門時(shí)，里面的寶物就全都消失不見，柯南提出的天花板和地板機(jī)關(guān)的猜想被光彥等人否認(rèn)，難道妖怪倉(cāng)庫(kù)真的存在？

日賣電視臺(tái)的特別節(jié)目《全國(guó)小島先生選手權(quán)大賽》即將開始，冠軍將會(huì)贏得一千萬(wàn)元的獎(jiǎng)金和一幅價(jià)值不菲的水墨畫軸，幸運(yùn)的是元太的父親經(jīng)過(guò)層層篩選獲得了參加決賽的資格，然而，就在比賽開始之前，主辦者小島權(quán)作不知被誰(shuí)推下了樓梯因而導(dǎo)致死亡，其中能夠使用這個(gè)樓梯的人就只有進(jìn)入決賽的三名小島先生，元太的父親也成為了嫌疑人之一，問(wèn)題的關(guān)鍵是到底誰(shuí)才是元太的爸爸？