利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？

目睹柯南墜崖的眾人陷入了痛苦和無助之中，警察署的搜查工作也一籌莫展，然而小哀卻覺得此事另有蹊蹺，便獨自上路尋找柯南。另一方面伊勢原在柯南的幫助下成功脫險，二人在山中的木屋與小哀相遇。在三人的設計和警方的幫助下，抓捕佐羅的行動圓滿完成。正當眾人以為此事已畫上句點時，柯南卻發現案件仍有疑點……

幫忙繪制屏風的少年偵探團卷入了殺人案件，通過元太手上的化妝品香味與現場的蛛絲馬跡，柯南斷定兇手就是職業高爾夫球運動員伴野貞悟，但他始終沒有找到關鍵性的證據，那便是伴野臉上被“兇手”寫下的文字。在屏風上酣睡的元太，臉上沾上了老虎紋的顏料，這個細節讓真相浮現了出來。

這天，下課了，米小圈看到平時活潑的劉凱竟然坐在自己的座位上折紙，他好奇過去慫恿劉凱一起來玩，劉凱傷心地說他家破產了，爸爸以前總是特別忙，現在賦閑在家好幾天了，并且很多天都沒有吃肉，現在他也只好折紙盒兼職做外快。看到劉凱那么難過，米小圈也忍不住心酸。晚上，米小圈看到家里餐桌上只有一只雞腿，母親在啃生蘿卜，父親在喝蔬菜汁，想到白天劉凱的遭遇，忽然也有種預感，難道他的爸媽也破產了！晚上，米小圈和劉凱通電話，將他家的伙食情況告訴了劉凱，小伙伴斷定他家真的破產了。為了幫助爸媽分擔，第二天上學，米小圈和小朋友商量怎么幫助爸媽度過經濟危機，他的小伙伴建議這世界一本萬利的方法就是用自己的腦子賺錢，他們決定可以用出租漫畫書的方式，這星期三個人忙壞了，終于賺了一百塊錢。有了人生第一桶金，米小圈和鐵頭興奮地憧憬著如果全校同學都來借他們的漫畫書會掙到更多，不久，鐵頭接到一份大單，有人要租全部的漫畫書，米小圈和鐵頭興奮了整整一上午，終于去到約定的時間，對了暗號，沒想到被班長李黎給抓了包。所有漫畫書也被班主任老師扣到了辦公室。晚上，米小圈回到家，看到爸媽依然把最好的食物推到他面前，媽媽繼續啃胡蘿卜，父親僅僅喝了一

外出露營的少年偵探團為了避雨來到了一棟別墅，別墅內的男傭人告訴大家最近房間內有幽靈出現。在交談中，柯南等人得知別墅的女主人不久前剛剛去世，而男主人則認為幽靈是女主人回到了家中。關于出現幽靈一事，女傭人似乎顯得十分不適，而男主人的侄子似乎行跡也有些奇怪。柯南察覺到幽靈之事必有蹊蹺，決心與少年偵探團一同查明真相。