在警方調(diào)查的過(guò)程中，他們還在下鴨的房間發(fā)現(xiàn)了一盤(pán)由絹川和輝主演的錄影帶，本來(lái)想看看其中有什么線(xiàn)索，不想小五郎和橫溝警官還很入戲的看完了，但柯南卻注意到了被他們所忽略的細(xì)節(jié)，這時(shí)，有鑒識(shí)人員說(shuō)兇手在勒死下鴨之前曾用蓬蓮頭敲打他的頭部，柯南根據(jù)這些判斷出兇手是誰(shuí)以及她所使用的兇器，之后，他又使用老方法將小五郎麻醉，在指示了橫溝警官做好相應(yīng)準(zhǔn)備后，一場(chǎng)精彩的推理就要開(kāi)始了！

柯南他們少年偵探團(tuán)坐阿笠博士的車(chē)去野營(yíng)。在那里認(rèn)識(shí)了4個(gè)戶(hù)外同好會(huì)的大學(xué)生。晚上他們中間的泰美卻不見(jiàn)了。柯南他們?yōu)榱藢ふ姨┟蓝鴣?lái)到放煙花的高臺(tái)，但在途中撞飛了落下的欄桿。到達(dá)高臺(tái)后仍然不見(jiàn)泰美的蹤影，在回來(lái)的路上，卻發(fā)現(xiàn)了倒在路邊的泰美遺體出現(xiàn)在街上。雖然看似事故的現(xiàn)場(chǎng)但在高木警官的提醒下警方最終確定是他殺事件！

某日，童星絹川和輝來(lái)到毛利偵探事務(wù)，委托小五郎根據(jù)他媽媽寄來(lái)的明信片找出她的所在，于是，柯南一行四人跑遍熱海的旅店進(jìn)行詢(xún)問(wèn)，最終找到了有這張明信片的旅店，店里除了三名女店員，還有一位叫下鴨的客人，當(dāng)晚，小蘭去給下鴨送鏡頭蓋時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)他被人勒死在浴室中，趕到案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的警察從下鴨當(dāng)時(shí)拍攝的照片中發(fā)現(xiàn)，兇手是一個(gè)胸口有痣的女人，絹川得知后很難過(guò)，因?yàn)樗赣H的胸口就有一顆痣。

終于到了正式盜取“藍(lán)色奇跡”這一天，鈴木博物館附近被人圍的水泄不通，而且次郎吉也加派了更多的直升機(jī)，柯南在樓頂?shù)却鲁霈F(xiàn)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)樓上有兩道新的刮痕，這時(shí)，基德如約而至，雖然突降大雨但這絲毫沒(méi)有造成任何影響，看著基德一步步接近寶石，次郎吉卻淡定的說(shuō)自己早有防備，他到底有何計(jì)劃？基德能否成功盜取寶石并順利脫身？柯南又會(huì)有什么樣的行動(dòng)？

柯南等人在警視廳鑒證連續(xù)發(fā)火現(xiàn)場(chǎng)遺留的紅馬現(xiàn)場(chǎng)照片，發(fā)現(xiàn)其中1張紅馬上有“兔”字，由此推出“紅馬”是三國(guó)志中出現(xiàn)的赤兔馬。另一方面，古董品店長(zhǎng)玄田隆德到訪(fǎng)諸角宅，由于他打算送給諸角亮子的塑像是騎乘著赤兔馬的關(guān)羽，玄田的名字引起了搜查線(xiàn)上的注意。在一系列的推理調(diào)查之后玄田被捕了，但柯南和平次卻發(fā)覺(jué)了這其中的異樣。最終在柯南和平次的聯(lián)手調(diào)查下犯人的真面目慢慢浮出水面。