柯南，小蘭和小五郎一行三人到飯店避暑，正巧在這里碰到了和其他律師一起來(lái)這里度假的妃英理，當(dāng)晚為了找尋酒醉未歸的小五郎，竟然發(fā)現(xiàn)了死在密室里的律師律子，然而糟糕的是，小五郎竟然就睡在這個(gè)房間里，于是小五郎就以案件重要關(guān)系人的身份被帶回了群馬縣警局，佐久作為辯護(hù)律師一同前去，而柯南和妃英理等人則留在現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查。

柯南得知了整個(gè)案件的真相之后，將小五郎麻醉并把旅店的所有人都叫到廚房，他首先請(qǐng)出了這起案件的關(guān)鍵——三郎，就在大家疑惑時(shí)，屋子里又出現(xiàn)了一只和三郎一樣的狗，柯南道出了連老板娘都不知道的隱情……解釋清楚三郎的事情后，接下來(lái)就是戳穿兇手，揭示真相的時(shí)刻，兇手根本就不是森林里帶黑色針織帽子的男子，相反的她就在這間旅店中，沒(méi)錯(cuò)，兇手就是……

柯南在從大阪回來(lái)的新干線中遇上了佐藤警官、高木警官。兩人正在押送毒品的秘密販賣者小倉(cāng)。途中車內(nèi)發(fā)現(xiàn)可疑的炸彈包裹。就在佐藤前去查看之時(shí)留下高木警官的時(shí)候，犯人小倉(cāng)要求去廁所，卻在廁所中用刀刺自己的腹部身亡。而在調(diào)查的過(guò)程中佐藤發(fā)現(xiàn)小倉(cāng)血跡的疑點(diǎn)，并推斷出這是他殺時(shí)間而非自殺。

返回旅店后，小五郎立馬給警方打電話，可是雪崩將隧道掩埋，警方無(wú)法及時(shí)趕來(lái)，因此旅店里的所有人都參與到了推理當(dāng)中，店里有旅客說(shuō)自己曾在樹(shù)林里看到了一個(gè)頭戴針織帽的可疑男子，之后，實(shí)果從二垣的相機(jī)中洗出了一張帶有黑影的照片，大家又一起觀看了二垣死亡前一天所拍的視頻，卻并未發(fā)現(xiàn)任何古怪，這時(shí)，柯南注意到了旅店里的小狗三郎并從它的身上發(fā)現(xiàn)了線索。

倫太郎家的餐廳來(lái)了一個(gè)叫龜倉(cāng)雄二的人，在他以報(bào)恩為目的來(lái)到這里之后，倫太郎家原本的冷清的餐廳因龜倉(cāng)的努力而漸漸生意興隆起來(lái)，可倫太郎總覺(jué)得事情沒(méi)那么簡(jiǎn)單，便拜托少年偵探隊(duì)進(jìn)行調(diào)查。龜倉(cāng)以想菜單為由總把自己關(guān)在屋子里，這讓柯南等人覺(jué)得很可疑，這時(shí)，光彥想到了福爾摩斯里的紅番聯(lián)盟案件，于是大家便以這個(gè)案件為參考展開(kāi)了調(diào)查，柯南認(rèn)為光彥等人的推理都不可靠，然而事情的真相卻將柯南狠狠打擊了一番。