經(jīng)過不斷的調(diào)查，柯南和平次終于知道了這起事件的始末，而小光這時(shí)又收到了來自洋房主人的簡(jiǎn)訊。假冒小光的合葉在小蘭的幫助下一同打倒了埋伏在南蠻房間里的兇手，敗露了行動(dòng)的兇手趁著昏暗的光線從暗道逃跑，被卡在暗道出口的他遇到的是平次和柯南，而兇手在燈光下顯現(xiàn)出來的臉是……

和笹本小姐一起晨跑的高木警官在路上撿到了一個(gè)皮包，打開之后里面竟是3千萬的巨額鈔票，沒過多久鈔票的失主平沼先生便來到了警局。經(jīng)過調(diào)查之后高木警官發(fā)現(xiàn)平沼先生丟錢的時(shí)間有所出入，仔細(xì)觀察后的柯南得出了結(jié)論，平沼先生是在早上故意將錢放在路上，而他想把錢交給的則是有著晨跑習(xí)慣的笹本小姐，但他的用意卻讓眾人很困惑。

在死去的西澤家里發(fā)現(xiàn)了作案的手法和遺書，看似自殺的現(xiàn)場(chǎng)還存在很多疑點(diǎn)，在現(xiàn)金還沒有歸還的情況下小五郎檢查繼續(xù)調(diào)查。西澤的好友田中和公司社長(zhǎng)的互相指正引起了小五郎的懷疑，而一路探查的柯南看到了漂浮在宇田川河面上的部分鈔票，經(jīng)過整理之后柯南得知了這次事件的兇手，而他將代替感冒的小五郎為大家揭曉真相。

為了完成寫生作業(yè)的少年偵探團(tuán)來到了米花市的郊外，在那里他們看到了草叢上的UFO，而這與一起殺人事件有著關(guān)聯(lián)。正當(dāng)柯南等人詢問高木警官時(shí)UFO的主人小沼博士出現(xiàn)了，在調(diào)查研究所時(shí)發(fā)現(xiàn)了死者和自己要好的大哥萬年先生都為大藏工作，小沼先生正好買了大藏的字畫，而身藏巨款的大藏臨死之前告訴死者和萬年的訊息便是UFO。

因?yàn)樯缴蠒r(shí)常有人白天生起營(yíng)火的緣故，柯南并不能根據(jù)濃煙判斷小哀等人的位置，柯南現(xiàn)在急于找出兇手問出同伴的下落。火勢(shì)蔓延的很快，小哀迫于無奈只能吃下解藥帶著孩子們沖出了木屋，柯南已經(jīng)根據(jù)自己的推理找到了真正的兇手，但被光彥傳出去的影片將會(huì)帶給他們很大的麻煩。