來(lái)到熊本阿蘇火山旅行的柯南等人不幸卷入了事件，盜取熊紋食品機(jī)密資料的犯罪嫌疑人試圖取回贖金時(shí)被步美打斷，藏有機(jī)密隨身碟的熊本熊玩偶陰差陽(yáng)錯(cuò)到了小男孩賈斯丁手中，與賈斯丁有過(guò)一面之緣的柯南等人好不容易才找到了他的線(xiàn)索，但卻被犯人搶先了一步，現(xiàn)在丟失的不只是機(jī)密文件，連同賈斯丁也被綁架了。

一封寄給服部平次奇怪的信件，里面有著一個(gè)月前殺害設(shè)計(jì)公司社長(zhǎng)若松耕田先生的殺人兇手寄來(lái)的東西，和葉代替感冒的服部依照信上的指示和朋友一起拜訪(fǎng)了若松先生的大阪老家，在哪里他們看到了一個(gè)頭發(fā)很長(zhǎng)令人毛骨悚然的人，而這個(gè)人在停電的時(shí)候卻消失的無(wú)影無(wú)蹤，更奇怪的是若松先生刻在瓷磚上的死亡訊息也跟著消失了。

和笹本小姐一起晨跑的高木警官在路上撿到了一個(gè)皮包，打開(kāi)之后里面竟是3千萬(wàn)的巨額鈔票，沒(méi)過(guò)多久鈔票的失主平沼先生便來(lái)到了警局。經(jīng)過(guò)調(diào)查之后高木警官發(fā)現(xiàn)平沼先生丟錢(qián)的時(shí)間有所出入，仔細(xì)觀(guān)察后的柯南得出了結(jié)論，平沼先生是在早上故意將錢(qián)放在路上，而他想把錢(qián)交給的則是有著晨跑習(xí)慣的笹本小姐，但他的用意卻讓眾人很困惑。

泡沫、熱氣和煙的實(shí)驗(yàn)與室溫并沒(méi)有關(guān)系，在聽(tīng)到三人單獨(dú)的問(wèn)話(huà)后柯南鎖定了兇手。再次來(lái)到公寓的柯南又實(shí)施了實(shí)驗(yàn)，事發(fā)時(shí)吵鬧不停的鬧鐘和他們到達(dá)案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的時(shí)間成為了案件的突破口，而柯南也明白了制造出不在場(chǎng)證明假象的手法，案件的真相終于揭曉，而在真相的背后又隱藏著不為人知的悲劇。

小五郎在酒吧里（后篇）