毛利小五郎受久須美工械廠社長(zhǎng)的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉庫抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

半年前毛利小五郎去杯戶北町工作時(shí)，碰巧遇到了一起事件。名為桐崎禮美的女性被發(fā)現(xiàn)吊死在自己的公寓中，因?yàn)榉繓|和桐崎的鄰居惠小姐都能證明她有自殺的傾向，外加她還留有一封遺書，所以事件被當(dāng)做自殺處理。桐崎的死讓惠小姐非常自責(zé)，而小五郎的話讓她重新振作了起來，為了感謝小五郎才有了今天的約會(huì)，但在約會(huì)中柯南卻看出那起案件的隱情。

唐三帶著小舞急匆匆趕回學(xué)苑，準(zhǔn)備參加下午的魂師會(huì)長(zhǎng)競(jìng)選大會(huì)，小舞信心滿滿，沒想到競(jìng)選大會(huì)早已經(jīng)結(jié)束了，蕭塵宇仗著人多勢(shì)眾當(dāng)選了魂師會(huì)會(huì)長(zhǎng)，還給附課生準(zhǔn)備了一份課程表，上午干活，下午還要工作，不但沒有時(shí)間上課，就連魂力訓(xùn)練也不能參加，根本不可能提升武魂，蕭塵宇擺明就是針對(duì)唐三和小舞，王圣忍不住替唐三打抱不平，勸他們倆趁早逃走，因?yàn)橹Z丁城和學(xué)苑都是蕭氏家族的。唐三無意中發(fā)現(xiàn)城主府的魂師凌風(fēng)派人抬著一個(gè)笨重的鐵籠子來到學(xué)苑，柳龍把他們帶到后院一間空房子里。唐三滿腹疑慮，就用意念召喚藍(lán)銀草，想進(jìn)去一看究竟，可唐三連試了幾次都不成功，他穩(wěn)定心神讓自己靜下心來，藍(lán)銀草越長(zhǎng)越大，他借助藤蔓爬上房頂，看到鐵籠子里是一只幽冥狼，那是凌風(fēng)抓來的，蕭塵宇拔劍殺死了這只狼，鐵籠子上方出現(xiàn)一圈白色的魂環(huán)，蕭塵宇把魂環(huán)緊緊握在手心里，他瞬間成為真正的魂師，揚(yáng)言要和唐三決一死戰(zhàn)。唐三連夜去找玉小剛請(qǐng)教，玉小剛勸他趁早放棄，蕭塵宇想要的是小舞，唐三不服氣，玉小剛答應(yīng)幫他獲得魂環(huán)，讓他今晚準(zhǔn)時(shí)來見面。深夜時(shí)分，唐三看到小舞已經(jīng)熟睡，就匆匆趕來見玉小剛，玉小剛要帶他去獵獸森林打魂獸得魂環(huán)，可是需要武魂殿的通關(guān)手令才能進(jìn)森

"圣魂村地處偏僻，山路崎嶇，村里人煙稀少，很少與外界接觸。在竹林深處的小木屋里，爐膛里的小火苗燒得正旺，盡管外面下著鵝毛大雪，可是小木屋里卻溫暖如春，少年唐三睡得正酣，他又一次夢(mèng)到自己來到一個(gè)魔幻世界，地上種滿了藍(lán)銀草，遠(yuǎn)處傳來一個(gè)女人溫柔的喊聲，她喊著唐三的名字，答應(yīng)會(huì)一直等他，唐三被夢(mèng)嚇醒，他覺得那溫柔的聲音是母親的。唐三冒著大雪出去劈柴，把爐膛的火加到更旺，他準(zhǔn)備好飯菜給父親唐昊送來，發(fā)現(xiàn)他又醉得不省人事，自從妻子三妹難產(chǎn)死后，唐昊就因傷心過度開始酗酒，唐三很小就看到父親這樣，他早已經(jīng)司空見慣，把父親扶到床上睡下。天剛蒙蒙亮，唐三就像平常一樣拿著那本“玄天寶錄”來到森林深處修煉絕技，這門絕技必須在清晨紫氣東來的時(shí)候修煉，唐三一心想練到玄天功第九重，可是過了第一重就遇到了瓶頸，他始終無法沖破。唐三聚精會(huì)神練功后，返程路上看到倒地的車子，聽到旁邊傳來奇怪的聲響，唐三扒開草叢，發(fā)現(xiàn)人面魔蛛只得慌忙逃跑，逃跑途中擺脫不了只能用他的暗器刺瞎人面魔蛛的眼睛。可這刺激人面魔蛛來尋仇，唐三拼命反抗，人面魔蛛對(duì)他步步緊逼，招招致命，唐三嚇得落荒而逃，魔蛛對(duì)他窮追不舍，唐三腳下一滑摔倒在地，他嚇得緊

少年偵探團(tuán)的理科自由研究作業(yè)是拍攝鎮(zhèn)子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭(zhēng)吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭(zhēng)吵的焦點(diǎn)。爭(zhēng)吵過后岳美負(fù)氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時(shí)候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發(fā)現(xiàn)山下的岳美小姐倒在了血泊中。