小五郎受邀來到Nijimura品牌店，卻正好目擊社長仁地村被人綁架的畫面。社長的妻子兼副社長沙希，按照綁架犯的要求帶著一億贖金搭電車解救人質(zhì)，就在電車開往中戶呂鐵橋的時(shí)候，沙希按照指示將包包從窗戶丟到河里，而此刻正趕上泄洪，包包隨著增加的河水被沖走，待警方在五公里外的河岸發(fā)現(xiàn)時(shí)，贖金已經(jīng)被犯人拿走，而社長仁地村也被殺害。雖然事情已經(jīng)結(jié)束，但柯南和小五郎卻重返現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查，并發(fā)現(xiàn)……

資產(chǎn)家片寄王三郎在家中中毒身亡，而片寄留下了一封暗號(hào)信來提示自己的財(cái)產(chǎn)所在地。中北無意的話點(diǎn)醒了柯南，而就在這時(shí)犧牲者再一次出現(xiàn)！這次是野笛小姐被箭射中中毒身亡，而在附近的樹屋找到了弓，而愛好弓的荻人成了頭號(hào)嫌疑人但就在這時(shí)卻傳來荻人墜崖的消息。最終在柯南的推理下找出了犯人，而一場(chǎng)遺產(chǎn)爭(zhēng)奪戰(zhàn)也浮出水面。

警方在將這三個(gè)嫌疑人分開偵訊之后，又在死者的包里發(fā)現(xiàn)了一把手槍和強(qiáng)盜集團(tuán)百鬼夜行留下的字條，并從小島權(quán)作的秘書那里得知，他舉辦此次活動(dòng)是為了尋找殺死自己愛犬的同叫小島的強(qiáng)盜頭目，于是柯南利用與死者相同的方法找出兇手，雖然證據(jù)被銷毀，但他巧施妙計(jì)讓兇手自己主動(dòng)承認(rèn)了罪行。

大家二次來到倉庫后發(fā)現(xiàn)了在門上方供奉著的神壇，而讓柯南更為好奇的是神壇對(duì)面的大算盤，這很可能是啟動(dòng)機(jī)關(guān)的鑰匙，仔細(xì)觀察倉庫之后，柯南發(fā)現(xiàn)了其中的蹊蹺，他叫來警察與他一起根據(jù)灰塵的多少撥動(dòng)算珠，果不其然，天花板漸漸向下移動(dòng)，警察不僅在這里找到了被盜的寶物還抓住了偷盜者，案件結(jié)束后，柯南揪出了那個(gè)一直暗中幫助元太他們的“軍師”，而這個(gè)人正是……

傳說中駕駛白色FD橫掃冬名山的銀白魔女，引起了小五郎調(diào)查的興趣，于是，他帶著柯南和小蘭向冬名山進(jìn)發(fā)，濃霧彌漫的山中魔女的FD果然出現(xiàn)了，小五郎拼命追趕，而魔女卻消失在沒有路的云霧之中，他立刻與正在盤查的山村警官聯(lián)系并攔下了所有的白色FD，有三組車手接受了盤查，銀白魔女是否就在他們之中？