城中美術(shù)館冒出中世紀(jì)盔甲會(huì)自己走路的傳聞，引起了小蘭濃厚的興趣打算一探究竟，沒想到卻意外地發(fā)現(xiàn)美術(shù)館在一周后即將關(guān)閉。而購買美術(shù)館的購買者真中計(jì)劃將這里改造成酒店。小蘭一行在參觀地獄館的過程中發(fā)現(xiàn)真中被釘在墻上，而在回放錄像的時(shí)候發(fā)現(xiàn)竟然是展覽的盔甲將真中殺害！但在回放了錄影帶和勘察現(xiàn)場(chǎng)之后柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法并找出了真兇。

小蘭的同學(xué)直子被綁架，當(dāng)歹徒發(fā)現(xiàn)有警察時(shí)，便放棄交易開車沖進(jìn)海里，直子再次下落不明，直子父親的秘書花井很是擔(dān)心。某日，小五郎突然接到不要在調(diào)查此事的要求，柯南察覺事有蹊蹺，暗暗潛入直子家后聽到了花井和直子爸爸的談話，原來直子的爸爸再次接到歹徒電話，但他卻不愿花五億保女兒的性命，這讓花井很生氣，柯南躲在后備箱里，跟著他們來到交易場(chǎng)所，見到了所謂的「歹徒」。

在酒店吃飯時(shí)，一個(gè)神色不安的人引起柯南的注意，柯南等人暗中跟蹤并進(jìn)一步詢問得知，此人名叫遠(yuǎn)藤，他的兒子被人綁架，為保兒子安全而沒有報(bào)警，小五郎決定幫他。次日，犯人打來電話要錢，遠(yuǎn)藤聽到了兒子說有螃蟹和鯨魚，這是找到犯人據(jù)點(diǎn)的唯一線索，小蘭、柯南和小五郎走街串巷的找有螃蟹和鯨魚的地方，柯南想起了漏掉的線索，順利找到有「螃蟹和鯨魚」的地方，將人質(zhì)解救。

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時(shí)撿到了一張畫有奇怪符號(hào)的紙，大家自行成立少年偵探團(tuán)去調(diào)查這些暗號(hào)，按照符號(hào)的指示先到達(dá)東京塔，在周圍展開偵查卻一無所獲，休息的時(shí)候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號(hào)的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標(biāo)記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號(hào)嗎？暗中跟蹤少年偵探團(tuán)的黑衣人又是誰？

毛利蘭受母親委托，與工藤新一一起到某間酒店，調(diào)查毛利小五郎是否在外面真的很花心愛玩。而就在此時(shí)，酒店突然開始舉辦游戲，內(nèi)容是20名酒店小姐排排站，由兩名客人每次各指定1-3名的小姐。先選到排在第20個(gè)的酒店小姐，同時(shí)也是該酒店第一紅牌的久美，就可以得到久美的熱吻當(dāng)作獎(jiǎng)賞。而這次參加這個(gè)游戲的是小五郎跟數(shù)學(xué)家峰正人，游戲進(jìn)行得非常熱烈，可是萬萬想不到最後竟然會(huì)鬧出人命...