FBI的所有警員立刻將送至各個(gè)病房的炸彈進(jìn)行回收，就在這時(shí)，水無(wú)憐奈出現(xiàn)在電視上，為一探究竟，所有搜查員都聚集到水無(wú)憐奈的病房，卻發(fā)現(xiàn)她好好的躺在那里，而這其實(shí)才是黑暗組織的目的，他們?cè)谡◤椛线€安裝了發(fā)訊器，這樣一來(lái)水無(wú)憐奈的位置一目了然。既然已經(jīng)暴露，那就只能立刻將她轉(zhuǎn)移，為混淆視聽，F(xiàn)BI派出了三輛車，但即便如此今恩還是做出了判斷。

在尸體旁邊的筆記本上死者留下了一個(gè)晦澀的死亡訊息，不論怎么想也理不出頭緒，之后，山村警官也趕來(lái)介入調(diào)查，他們將目標(biāo)鎖定在山下旅館投宿的三位客人當(dāng)中，就在這時(shí)，柯南像是想到了什么，他獨(dú)自一人返回山里并在一棵樹下挖出了白骨，于是他就在這里等待兇手自投羅網(wǎng)，然而，讓他沒(méi)想到的是對(duì)方居然帶領(lǐng)了一大波人……

在去往餐館的路上，柯南和小五郎目睹了一起車禍，所幸受害者立松新三郎和小此木清隆都沒(méi)有生命危險(xiǎn)，本以為這是場(chǎng)單純的車禍，但有目擊者表示那輛肇事車并非偶然經(jīng)過(guò)，如此看來(lái)這是一起殺人未遂案件。隨后警察找來(lái)了小此木的外甥和她未婚妻一倉(cāng)分別進(jìn)行了偵訊卻并未發(fā)現(xiàn)異常，這時(shí)，“日本第一倒霉的男人”立松說(shuō)歹徒的目的是置他于死地，事情的真相果真如立松所說(shuō)嗎？

簡(jiǎn)單問(wèn)過(guò)案情之后，小五郎隨警方來(lái)到案發(fā)的二樓進(jìn)行查看，根據(jù)死者頭部的槍傷，推斷出兇手的身高應(yīng)該在在180cm左右，雖然船本先生有嫌疑但卻低于死者，種種推斷都否決了船本殺人的可能，然而，柯南卻在他輪椅上發(fā)現(xiàn)了蔥，沒(méi)錯(cuò)，兇手就是他，可是他到底是如何犯案？消失的珍珠項(xiàng)鏈又被如何處理了？

30年前，莊堂胡桃被一位少年從車禍中救回一命，如今，她想把偶然中得的一億獎(jiǎng)金轉(zhuǎn)送給自己的恩人，線索就是少年身上巨大的疤痕以及夏日海灘的記憶，期間，有兩名男子前來(lái)認(rèn)領(lǐng)，為了辨認(rèn)誰(shuí)才是正牌貨，柯南他們來(lái)到了莊堂家，沒(méi)想到在這里碰到了正在追查快要超過(guò)追訴期的殺人案的目暮警官，因?yàn)槟敲麅词稚砩弦灿幸坏纻?。?dāng)晚，小五郎泡澡的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)管家保谷泰輔背上有一道傷痕，胡桃回憶中的少年究竟是誰(shuí)呢？