紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

紀曉嵐從鴿子賣主口中得知鴿子可以傳信，聯想到和珅收購大量鴿子，紀曉嵐有所覺悟。趙青找到和珅，懇求其允許自己替哥哥考試。一曾經被紀曉嵐救助過的翰林將和珅收買眾翰林替考生答卷作弊并由鴿子傳送的消息透露繪紀曉嵐。紀曉嵐命小月在適當的時候燃放爆竹，以驅趕鴿群。趙青得知考生均要過“凈身池”很是擔心，她面露猶豫之色引起士兵的懷疑。正在兩人拉扯之時，紀曉嵐出現并堅決表示不會讓趙青進入考場。為了拉攏趙青為自己效力，和珅以趙青忠孝為由，懇請乾隆傳其入場，紀曉嵐卻以“無規矩不成方圓”為由大加反對。小月跟蹤和琳，發現了眾翰林答卷的密室，正當小月想要察看一番時，卻被和琳發現并打暈。小月醒來發現試卷已被鴿子帶走，便飛馬趕往考場。沒有小月的命令，等候放爆竹的人誰也不敢動手，眼睜睜地看著鴿群飛過。紀曉嵐將準備好的誘鴿放上天，鴿群在誘鴿的帶領下紛紛落地。小月趕到并下令放爆竹，結果鴿群受到驚嚇又再次飛上天，和珅幸災樂禍。得知自己高中，趙青深感愧疚，于大堂之上向乾隆揭露考試內幕。

紀曉嵐在眾信徒面前一一揭露了李二設下的騙局。眾信徒醒悟，李二只得低頭認罪。紀曉嵐將當初留在海升之妻身上的四指掐痕與任五的手印做對比，兩者吻合，乾隆意識到海升被陷害。紀曉嵐讓海升與小芳做臨別遺言，兩人真情流露，隔壁的乾隆終于了解了冤情。乾隆下令嚴懲真兇，并賜海升與小芳完婚。早朝之時，乾降于閑談之中指出朝廷里存在結黨營私、欺上瞞下的現象，百官皆心虛不已，噤若寒蟬。下朝后，和珅竭力表示自己一身清白，卻偏偏遇到了正在等候自己的同黨——浙江巡撫盧焯。

左山傀無意中提到香積庵，紀曉嵐與趙青前去探訪。考場之外，和珅與敏德三人當著小月做出嚴查之勢，實則根據考生文具上的標記，使那些花錢作弊的考生順利進入考場。正當和珅得意之時，紀曉嵐趕到，將敏德手下負責搜檢考生的兵丁全部調換，并重新進行檢查，將已經蒙混過關的考生查出。趙青詫異于吳盛欽沒有參加恩科考試，吳盛欽卻表示自己以重金賄賂考官，不用考試也能坐上官椅。和珅發現趙青欲找紀曉嵐告發此事，便派人將其劫持到香積庵以滅口。和珅等人本以為考試結束便萬事大吉，誰知紀曉嵐提出為了避免考生在試卷上留暗語作弊，要找人重抄試卷。正當趙文龍及眾閱卷官不知如何是好時，左山傀想出一計。

為避免和珅從中舞弊，紀曉嵐自薦調查此事。紀曉嵐推薦不畏權勢的海升進行調查。和珅讓劉三盡快將煤窯脫手，劉三似有難言之隱。小月假扮皇室之人，與海升進山察探，表示要買下煤窯并約劉三在酒樓詳談。劉三得知后暗自慶幸，迫不及待地前去和海升商談買賣煤窯之事，被早已等候于此的紀曉嵐捉拿歸案。和珅表示自己查出劉三是開窯之人，并要求紀曉嵐從嚴查處，以示自己秉公執法。眾人規勸海升看在和珅的面上放過劉三，以給自己留后路，海升堅持要秉公處理，和珅擔心劉三供出真正的幕后主使而連累自己，于是命劉三服毒自盡。海升欲繼續調查，卻得知劉三已死并被家人拉回老家埋葬。