關(guān)西的名高中生偵探服部平次，為了合氣道比賽而來(lái)到帝丹高中。工藤新一與平次雖然沒(méi)見(jiàn)過(guò)彼此，在心里卻把對(duì)方當(dāng)成對(duì)手，可是表面上又裝出完全不在乎對(duì)方的樣子。後來(lái)平次在去帝丹高中的路上碰到搶匪，與毛利蘭一起在回家途中的新一，也一起幫忙追搶匪。後來(lái)是靠新一踢足球擊中搶匪，不過(guò)也同時(shí)打破一間民宅的玻璃，而里面還傳出女人的凄厲尖叫聲...

這時(shí)，二樓傳來(lái)老師們的慘叫，柯南和小蘭跑上去發(fā)現(xiàn)下田被人勒死，柯南立即開(kāi)始找兇器，但并未找到，唯一能確定的是，兇手就在中村、米原和坂井之間，接下來(lái)的搜尋中，柯南在下田脖子上發(fā)現(xiàn)了頭發(fā)，兇手就是那個(gè)人！可是該通過(guò)誰(shuí)之口揭穿兇手呢，園子昏睡不了解案情，正值苦惱之時(shí)，他想到以工藤的的身份讓小蘭用便攜電話說(shuō)出真相，而小蘭卻在得知真相后痛哭不已。

打棒球時(shí)，元太不小心傷到一名流浪畫(huà)家，送到醫(yī)院檢查才知道他失去了記憶，后來(lái)畫(huà)家悄悄離開(kāi)。幾日后，畫(huà)家的尸體被發(fā)現(xiàn)，為調(diào)查真相，少年偵探團(tuán)出動(dòng)，他們按照畫(huà)家的素描找到了一戶(hù)叫早瀨的家中，主人熱情招待這群孩子，柯南留意到這位夫人丈夫的遺像和死者很相像，進(jìn)一步調(diào)查后，他將銀杏、窗戶(hù)、燒焦的痕跡、帶眼鏡的被害者、墻壁上的畫(huà)串聯(lián)起來(lái)，沒(méi)錯(cuò)！兇手就是她。

柯南、小蘭和小五郎碰帶了一個(gè)深情恍惚的少女，送去醫(yī)院檢查后，醫(yī)生說(shuō)少女暫時(shí)失去記憶，幾人從僅有的信息中找到了她所住的飯店，柯南不停的詢(xún)問(wèn)讓少女頭疼而跑出酒店，突然有一輛汽車(chē)迎面開(kāi)來(lái)，但少女靈敏被避開(kāi)，調(diào)查過(guò)程中柯南發(fā)現(xiàn)這名女子身手矯健總能避開(kāi)危險(xiǎn)，她到底是什么人？為什么總遭到襲擊？

柯南注意到這些音符并將其解讀，這時(shí)，當(dāng)?shù)氐睦暇煺f(shuō)倉(cāng)庫(kù)里有麻生圭二留下來(lái)的樂(lè)譜，這種重要線索柯南自然不會(huì)放過(guò)，他和警察一起去找樂(lè)譜，而這期間，一直精神怪異的西本上吊死亡，腳下還留有遺書(shū)，柯南推斷出這是他殺，當(dāng)在看到麻生圭二留下來(lái)的樂(lè)譜后，柯南斷定出了兇手，他利用變聲領(lǐng)結(jié)和廣播室說(shuō)出真相。