這天柯南陪同小蘭和園子來練瑜伽減肥，這時(shí)他們碰到來參加減肥班的出川，而出川厚子故意的刁難的態(tài)度迫使教練里月跪下息事寧人。而在晚上的訓(xùn)練厚子也早退走掉，獨(dú)自回到屋里。訓(xùn)練之后保子因?yàn)榍貌婚_出川的門而來找里月，但開門之后出現(xiàn)的確實(shí)中毒身亡的出川！在勘察現(xiàn)場之后肯納發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法，犯人也承認(rèn)了因?yàn)閳?bào)仇而殺人的事實(shí)。

阿笠博士的金龜車在半路拋錨，導(dǎo)致他和灰原只能在路邊等便車，碰巧這時(shí)來了一輛前往東京的車子，車主是一對古怪的情侶，并且灰原還在車內(nèi)發(fā)現(xiàn)了彈孔和血跡，更恐怖的是她聽到這對情侶說要找到柯南把他弄個(gè)半死之類的話，驚恐的灰原趁機(jī)打電話向柯南求救，沒想到一直按照柯南指示的她竟然被這對情侶抓個(gè)正著，這兩個(gè)人是黑暗組織成員嗎？柯南又是出于什么原因讓灰原和博士乖乖被抓？

小五郎，柯南和小蘭三人在前往泡溫泉的路上遇到了一起交通意外，其中駕駛紅色車子的速水當(dāng)場死亡，另一位車主車谷整司則身受重傷，據(jù)當(dāng)?shù)亟痪f發(fā)生車禍的原因可能是因?yàn)闆_撞路線現(xiàn)象，但柯南卻并不認(rèn)為這是單純的交通事故，因?yàn)樗霸诒憷暌娺^這兩輛車子，當(dāng)時(shí)明明是開往不同的方向?yàn)槭裁磿绱饲珊系陌l(fā)生相撞，調(diào)查之后，事情果然如他料想一般，這是一起有預(yù)謀的殺人案。

柯南、小蘭和小五郎在百貨公司吃飯的時(shí)候，結(jié)識了樂隊(duì)吉他手中村悠介，之后，小蘭和他一起去地下室拿取CD，沒想到竟然在休息室看到了主唱渡邊友紀(jì)子的尸體，警方立刻展開調(diào)查并且對樂隊(duì)其他人進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都有殺人的動機(jī)和嫌疑，就在他們互相指責(zé)懷疑之時(shí)，柯南在八樓發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵性的線索，兇手果然就是那個(gè)人！

為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個(gè)小女孩在一起，同時(shí)照片上還出現(xiàn)了一個(gè)行蹤可疑的男人。這時(shí)，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來找一個(gè)叫陽菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個(gè)孩子。據(jù)陽菜的父親周平所說，在陽菜失蹤的同時(shí)他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時(shí)，陽菜和小蘭遇到了危險(xiǎn)。