受宿里村村長(zhǎng)之邀，柯南和平次等人共同前往宿里村尋寶。到達(dá)旅店后，通過(guò)與其他幾位考古學(xué)家和歷史學(xué)家交談，他們得知在寶藏的埋藏之處曾發(fā)生過(guò)塌方事故，其中一位外國(guó)挖掘隊(duì)員在彌留之際寫(xiě)下了意為“鵺”的字條，而鵺正是傳說(shuō)中極為兇猛的怪獸。飯后當(dāng)眾人準(zhǔn)備回房休息，平次卻突然發(fā)現(xiàn)門(mén)前失火，眾人在火中看到了體型巨大的怪獸。為了一探究竟的柯南和平次在追蹤怪獸的過(guò)程中，卻發(fā)現(xiàn)了倒在血泊中已經(jīng)喪命的歷史學(xué)家。

阿笠博士帶著少年偵探團(tuán)去朋友家的別墅玩，眾人卻在別墅的院子里發(fā)現(xiàn)一名倒在血泊中的男子，經(jīng)證實(shí)此人正是俗稱(chēng)“佐羅”的連環(huán)搶劫縱火犯的同黨伊勢(shì)原祐二。為了解開(kāi)謎團(tuán)，柯南只身一人前往深山，目睹了佐羅意圖殺害伊勢(shì)的場(chǎng)面。想要解圍的柯南在和伊勢(shì)一起逃亡的過(guò)程中被逼上了臨海的懸崖，在佐羅的追殺中不慎墜落懸崖的二人命運(yùn)將會(huì)如何？

小蘭和園子聊著幼稚園時(shí)的往事，新一當(dāng)時(shí)所做出的櫻花名牌推理，正是他的第一次推理，而在小蘭不知道的情況下新一一直在背后默默地守護(hù)著她。櫻花班班主任江舟論介看小蘭的眼神讓新一非常在意，他認(rèn)為這個(gè)老師是故意想要和小蘭親近，他所作出的解釋看似合理，但新一依舊無(wú)法放松警惕，新一的父親工藤優(yōu)作得知后也展開(kāi)了調(diào)查。

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫(huà)線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開(kāi)玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門(mén)，眾人合力打開(kāi)門(mén)后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

唐三為小舞梳頭，不由地聊起了各自的家庭，兩個(gè)人越聊越投機(jī)，小舞高高興興去吃飯，王圣等人趕忙湊過(guò)來(lái)好奇地問(wèn)東問(wèn)西，唐三心里坦蕩蕩，他夸小舞是一個(gè)很單純的姑娘。蕭塵宇派柳龍?jiān)谂鷮嬍艺伊艘淮笕Γ膊灰?jiàn)小舞的人影，沒(méi)想到小舞竟然住在七舍，而且還是這里的老大，蕭塵宇大為惱火。小舞興沖沖拉著唐三去食堂吃飯，蕭塵宇邀請(qǐng)小舞去魂師會(huì)館吃好吃的，小舞根本不領(lǐng)情，柳龍沖小舞大呼小叫，要強(qiáng)行拉她走，小舞飛起一腳把柳龍打翻在地，蕭塵宇?lèi)佬叱膳€搬出苑長(zhǎng)是他三叔來(lái)說(shuō)事，唐三根本不買(mǎi)賬，拉起小舞就去食堂吃飯了。理論課考試的時(shí)候，柳龍不會(huì)答題，就搶了王圣的卷子，還倒打一耙，誣陷王圣作弊，唐三和小舞站出來(lái)揭穿柳龍，監(jiān)考老師不容分說(shuō)把柳龍和王圣趕出去。接下來(lái)就是武魂格斗課，教官讓蕭塵宇給同學(xué)們做示范，蕭塵宇讓唐三做他的搭檔，其實(shí)就是想讓唐三當(dāng)活靶子，趁此機(jī)會(huì)好好教訓(xùn)唐三，蕭塵宇揮拳擊打唐三胸口，他被打得站立不穩(wěn)差點(diǎn)摔倒，蕭塵宇步步緊逼，招招致命，一一被唐三巧妙化解，兩個(gè)學(xué)員分別死死拉住唐三的手臂，蕭塵宇揮拳狠狠打向他的腹部，唐三紋絲不動(dòng)，蕭塵宇感覺(jué)有一股巨大的反擊力量，十分驚訝唐三如何反擊的。教官讓學(xué)員們擊打沙袋練