紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

三個完全不同的陌路人各懷心思，只坐在同一張酒桌前。和大耍手腕，拼命拉攏迷惑對紀曉嵐產生誤解的小月，四姑娘則靜觀事態發展，伺機而動。 紀曉嵐明查暗訪，終于找到老病纏身、雙目失明的御醫呂長安。 福康安率大批官兵，興師動眾搜查德和堂藥鋪，一來是詢查呂長安下落，二來是關心丹藥的進展情況，與此同時，一對黑衣女子被小月、四姑娘發經過激烈打斗，小月被綁架。 小小的臨青州突然之間風云際會，幾路人馬蜂擁而至，勾心斗角。四姑娘伺機接近紀曉嵐，二人暗中較量，明里交鋒，紀曉嵐以詩作謎，透露煉丹藥的事，觀察四姑娘的反映，四姑娘如獲至寶，允諾立即釋放小月。 和以只談小月不談政事搪塞匆匆而至的紀曉嵐，紀曉嵐則有意遺下一紙短簽，告之呂長安藏身之地。 這天三更，紀曉嵐造訪德和堂藥鋪，向何掌柜指出煉丹藥的利害弊病，希望他以大局為重，出面保護老友兼親家的御醫呂長安。

乾隆被了凡的絕色容貌所迷惑，喝了被下了藥的茶而昏迷，也被關進地牢。得知皇上和紀曉嵐同在地牢，和珅深感大禍臨頭，于是與敏德商議先發榜，然后再殺了凡滅口以瞞天過海。敏德佯裝要放了凡生路以騙得考試所收的財物。了凡料到自己難逃厄運，便交給敏德一個空箱。待敏德發現，為時已晚。乾隆對香積庵里的蹊蹺之處感到不解，紀曉嵐道出此庵正是考生、考官行賄、受賄的交易場所，并懇請皇上不要打草驚蛇。看到發榜結果，考生們群情激憤。趙文龍、左山傀在和珅的指示下，欲讓吳盛欽裝瘋以擺脫考生們的包圍，然后派人將其滅口以掩蓋罪行，再嫁禍紀曉嵐。陰謀敗露，趙文龍、左山傀欲逃，敏德佯裝義正詞嚴地將兩人捉拿歸案。和珅擔心繼續追查下去會連累到自己，一方面以穩定民心為由勸乾隆適可而止，一方面殺趙文龍、左山傀滅口。

盧焯告知和珅往來于兩人之間負責傳信的家丁被殺，雖然信件沒有丟，但在家丁身上卻發現了一首詩，暗示此舉是紀曉嵐所為。正當和珅擔心自己與盧焯的暗中交易有所敗露時，卻碰巧發現為了寫書而在茶社里擺攤收故事的紀曉嵐。乾隆向和珅詢問盧焯此人，和珅以為乾隆在試探自己。和珅假意推薦紀曉嵐前往浙江調查盧焯，誰知弄巧成拙，正合了乾隆的心意。和珅以買古董為由將乾隆帶到茶社附近，示意躲在暗中的阮媽適時出現，阮媽按照和珅的吩咐向紀曉嵐講述小月的身世，那邊廂，小月也在對杏兒講述著紀曉嵐對自己的恩德及自己對紀曉嵐的情意。紀曉嵐狼狽不堪地回到家里，提議讓小月嫁人，讓謠言不攻自破，小月氣極，表示除非讓皇上做媒

京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。