這件兇案的最大疑點(diǎn)就是，兇手從這個(gè)亂七八糟的黑暗房間逃跑的時(shí)候，居然沒有發(fā)出任何聲響，而且門鎖也沒有被破壞的痕跡，由此看來，睡在死者身邊的穗島嫌疑最大，可穗島卻說唐田和根上也都有這間屋子的鑰匙，于是，警方找來這二人進(jìn)行偵訊，得知案發(fā)時(shí)兩人都沒有不在場證明，既然如此，嫌疑犯就有三人，這時(shí)，警方發(fā)現(xiàn)死者身上少了一顆紐扣以及地上的攝影機(jī)，查看過影像大家仍未發(fā)現(xiàn)有何異常，而那顆不翼而飛的紐扣就成了破案的關(guān)鍵。

白鳥警官的車突然發(fā)生爆炸，所幸他并沒有當(dāng)場死亡而是被立馬送去了醫(yī)院，在他的手中，佐藤警官還發(fā)現(xiàn)一封和三年前相似風(fēng)格的挑戰(zhàn)書，為了尋找炸彈，警察在慌亂中展開調(diào)查，柯南也從佐藤警官那里得知了，這個(gè)爆炸狂與警察的淵源，七年前警察和兩名歹徒產(chǎn)生了誤會(huì)，而導(dǎo)致其中一人出車禍死亡，于是這名活下來的歹徒便安放炸彈報(bào)復(fù)警察。

幸運(yùn)的是兩人都沒有受傷，演出也能順利進(jìn)行。然而，就在大家驚訝于華麗的舞臺(tái)和逼真的場景時(shí)，煙霧繚繞劇場內(nèi)卻發(fā)生了命案，死者是話劇的男主角，案發(fā)時(shí)，新一立刻跑到舞臺(tái)上并在那里發(fā)現(xiàn)了手槍和空彈殼，之后又想起了出現(xiàn)在舞臺(tái)上的紅色瞄準(zhǔn)線，但他卻不認(rèn)為兇手是從觀眾席殺人，反而肯定兇手當(dāng)時(shí)就在舞臺(tái)上，而嫌疑最大的就是和男主角糾纏不清的四名女演員。

發(fā)燒的小哀醒過來發(fā)現(xiàn)阿笠博士倒在了電腦之前，正當(dāng)小哀以為教授被黑衣人殺害的時(shí)候發(fā)現(xiàn)只是誤會(huì)。之后柯南，小哀和阿笠博士去拜訪了哀的父親宮野博士的朋友出島。他們認(rèn)為他可能多少知道一點(diǎn)黑暗組織的以及哀父親的行蹤，但是出島也已經(jīng)30多年沒和宮野博士碰頭了。但是就是最近宮野博士女兒明美曾來拜訪過，正當(dāng)柯南，小哀尋找明美留在這里的物品時(shí)出島卻意外死亡！

與黑色組織面對(duì)面 滿月之夜的兩起神秘事件(之五)柯南昏倒，茱蒂受傷，蓓摩特的槍口指向灰原，千鈞一發(fā)之刻，一直躲在后車廂的小蘭突然沖出來，緊緊抱著灰原，面對(duì)這種意想之外的狀況，蓓摩特想起了往事而不忍下手，趁她分神的時(shí)候，與茱蒂同屬FBI的赤井秀一出現(xiàn)，雖然保護(hù)了無辜的人，但蓓摩特卻以柯南為人質(zhì)成功逃脫。途中柯南從昏睡中蘇醒，接下來就是柯南與蓓摩特的單獨(dú)對(duì)峙，他能否根據(jù)蓓摩特的電話找出黑暗組織的boss？