找到兇器成了破案的關(guān)鍵，小五郎發(fā)現(xiàn)抽屜里的冰鎬少了一根，加之對(duì)大家物品的檢查認(rèn)定矢代就是兇手，可是柯南卻發(fā)現(xiàn)消失的冰鎬被用來(lái)固定植物了，繼而小五郎又認(rèn)定上森的兒媳熏兇手，熏指出這里的每個(gè)人都有殺人動(dòng)機(jī)并否定自己是兇手，到底誰(shuí)是兇手呢？這時(shí)，柯南從目暮警官和小五郎的談話中得到啟示，找到兇器之后，沒(méi)錯(cuò)，兇手就是那個(gè)人！

少年偵探團(tuán)從事務(wù)所的答錄機(jī)上聽(tīng)到天氣播報(bào)員淺野亞紀(jì)的留言，便私自決定代替小五郎去處理事件，來(lái)到電視臺(tái)后，亞紀(jì)熱情招待大家，還記下了柯南的call機(jī)的號(hào)碼，期間，亞紀(jì)接到了一通電話匆匆離去。在等待的過(guò)程中，柯南的call機(jī)收到了亞紀(jì)發(fā)來(lái)的留言，根據(jù)這些陸續(xù)發(fā)來(lái)的數(shù)字，大家推斷出亞紀(jì)一定是遇到了危險(xiǎn)，經(jīng)過(guò)反復(fù)推敲和琢磨，柯南終于明白了其中的含義，并按照這個(gè)訊息找到了被綁架的亞紀(jì)。

柯南等人受邀參加假面超人影迷俱樂(lè)部的派對(duì)，派對(duì)還沒(méi)開(kāi)始多久，突然沖出一名叫三島的男子將假扮成突擊警察的本田先生射殺，繼而自己又舉槍自盡。所幸的是本田穿了件防彈衣，只是輕微受傷，并無(wú)生命危險(xiǎn)。眼見(jiàn)不一定為實(shí)，在大家都以為三島是自殺的時(shí)候，柯南察覺(jué)到這其實(shí)是件蓄意謀殺案。

九十九七惠通過(guò)妃英理的介紹來(lái)到毛利偵探事務(wù)所，她拜托小五郎幫她重新調(diào)查丈夫著名魔術(shù)師九十九元康的死因，一行人來(lái)到九十九家中，見(jiàn)到了元康的三個(gè)學(xué)生真田一三 、三好麻子和白地裕士，簡(jiǎn)單的照面之后，他們來(lái)到元康的死亡現(xiàn)場(chǎng)——地下室，柯南仔細(xì)進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)勘查，發(fā)現(xiàn)了電話上一串奇怪的數(shù)字，期間，小蘭對(duì)柯南起了疑心，而暗中觀察他，但柯南毫無(wú)意識(shí)。

少年偵探團(tuán)因成功抓捕強(qiáng)盜而大出風(fēng)頭，某日，大家一起外出的時(shí)候，步美被一輛急駛而過(guò)的紅色轎車撞傷，柯南用滑板載著光彥和元太一起去追肇事車輛，奇怪的是，每到轉(zhuǎn)角車子都會(huì)停下來(lái)，好像故意等他們一樣，當(dāng)柯南等人追到石倉(cāng)工廠時(shí)，車子不見(jiàn)蹤影，之后，車子有突然出現(xiàn)并一路駛向警察局，沒(méi)過(guò)得多久，柯南等人得知石倉(cāng)工廠發(fā)生了命案……