隔壁班的女生百合子找到少年偵探團(tuán)，拜托他們解開(kāi)她從未謀面的曾祖父所留下的謎題，于是，大家在一位身份不明自稱(chēng)是時(shí)鐘的男人的帶領(lǐng)下來(lái)到了謎題的所在——天使之館，當(dāng)晚九點(diǎn)，解謎游戲正式開(kāi)始，元太和光彥、步美和灰原都在別館的不同地方發(fā)現(xiàn)了謎題中的無(wú)角牛，可是卻沒(méi)有更進(jìn)一步的發(fā)現(xiàn)。次日，柯南從另外一個(gè)角度思考謎面，并成功找到了第一個(gè)線索，沒(méi)想到這時(shí)卻……

小蘭、柯南、服部以及和葉一行四人去看魔術(shù)師星河童吾的奇幻魔術(shù)秀，在表演水中脫逃的時(shí)候，和葉和小蘭以為魔術(shù)失敗，便沖向舞臺(tái)準(zhǔn)備救人，卻沒(méi)想到這只是為了營(yíng)造舞臺(tái)效果而做的表演。為表歉意，和葉和小蘭來(lái)到后臺(tái)，并在這里遇到范田和姬宮，原來(lái)他們都是十年前失蹤的魔術(shù)師正影的弟子，之后，他們四人受邀來(lái)到了正影家，可就在這短短的時(shí)間內(nèi)竟然發(fā)生了命案。

柯南，小蘭和園子與本堂瑛祐來(lái)到園子的別墅。但路上卻發(fā)現(xiàn)必經(jīng)的吊橋塌了。小蘭等人決定在有人來(lái)接他們前先前往附近的別墅休息。屋主槇野純，天堂享，倉(cāng)本耀治說(shuō)他們的別墅被詛咒了。這棟別墅最初是一對(duì)富翁兄弟建造的，哥哥說(shuō)有妖怪從窗外潛入了別墅后便封印了窗戶而次年，哥哥和妻子就相繼去世。之后瑛祐發(fā)現(xiàn)窗子上奇怪的影子，之后眾人發(fā)現(xiàn)了在屋里上吊身亡的倫子！

警方調(diào)查期間本山總是鬼鬼祟祟的像是在謀劃著什么，他提議大家一起去吃飯，然后又謊稱(chēng)自己有東西落在了車(chē)上，返回座位偷偷拿走了小蘭裝在包里的網(wǎng)球，然而暗自慶幸計(jì)劃成功的本山還不知道，這時(shí)的警方和小五郎早在柯南的提醒下，知道了他就是兇手以及他的作案手法，于是，大家暗中尾隨他來(lái)到機(jī)場(chǎng)，在他企圖逃逸之前將他的罪行揭穿！

情況危急，柯南立刻給江尻做人工呼吸，并讓阿笠博士帶著他搭乘漁夫井田的船趕往醫(yī)院，當(dāng)白根和金谷想要一同前往時(shí)，柯南卻出口阻撓，因?yàn)檫@起案件是蓄意謀害，而在這條防波堤上的所有人都有犯案的可能，現(xiàn)在能做的就保護(hù)犯案現(xiàn)場(chǎng)等待警察的到來(lái)。期間柯南對(duì)現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查發(fā)現(xiàn)了一些線索，并在阿笠博士打來(lái)電話報(bào)告情況后，排除了井田犯案的嫌疑，那么制造這起案件的就是白根和金谷中的一人。