阿笠博士住在鄉(xiāng)下的老友龍?zhí)赡抢飫偤糜性麄兿胍纳钌介毙蜗x(chóng)，在柯南等人捉蟲(chóng)回來(lái)時(shí)卻發(fā)現(xiàn)龍?zhí)纱笫宓乖诹说厣希T口的佛像也不翼而飛，再留下“深山楸形”幾個(gè)字后龍?zhí)杀銜灹诉^(guò)去。與龍?zhí)捎型恋剡吔鐔?wèn)題糾紛的周平和時(shí)常會(huì)偷盜佛像的慶都因與“深山楸形蟲(chóng)”有關(guān)系而被懷疑，經(jīng)過(guò)調(diào)查而前往道之站的柯南認(rèn)為兇手另有其人。

圍繞著由推理游戲急轉(zhuǎn)成的殺人事件，柯南在詢問(wèn)過(guò)車內(nèi)有嫌疑的人后漸漸有了線索，事件背后的兇手終于露出了馬腳，正在他上演推理秀時(shí)卻有其他的事情發(fā)生。單獨(dú)出去的小哀至今未歸，而世良真純也被神秘人物電暈帶走，但這個(gè)車上還藏著不一般的人物，最后誰(shuí)是贏家現(xiàn)在還沒(méi)有定論。

被初音小姐雇傭的偵探安室透在調(diào)查伴場(chǎng)先生時(shí)發(fā)現(xiàn)了一件事，初音小姐和伴場(chǎng)先生都是從同一間飯店獲救的嬰兒，兩人都是在身份不明的情況下在同一所教會(huì)中撫養(yǎng)長(zhǎng)大，聽(tīng)到這些之后的初音非常在意。所有的證據(jù)都指向了伴場(chǎng)先生，在車底找到初音小姐掉落指甲的柯南似乎看出了事情的真相，這背后或許有著令人悲傷的事實(shí)。

小蘭、園子和世良三人在上學(xué)途中發(fā)現(xiàn)了路旁的遺體，遺體的旁邊留下了用血寫(xiě)下的“死”字，這就和十年前工藤優(yōu)作唯一沒(méi)有揭穿犯人的事件幾乎一樣，為了調(diào)查這兩期案件的共同點(diǎn)，他們打電話給高木警官，但參與十年前案件的目暮警官看過(guò)遺體后卻以竊盜事件定性，回憶著十年前的一幕幕柯南依舊沒(méi)有明白自己父親的用意。

高木警官完全沒(méi)有向任何人告知行蹤便獨(dú)自出了遠(yuǎn)門，在警視廳門前等待高木警官的少年偵探團(tuán)們遲遲等不來(lái)人，這時(shí)一個(gè)男人交給了他們一個(gè)說(shuō)是高木警官送來(lái)的包裹。佐藤警官打開(kāi)包裹后發(fā)現(xiàn)里面放著一個(gè)平板電腦，按下電源后看到的竟然是身處于危險(xiǎn)之中的高木警官，即便高木警官還保持著冷靜，但體力透支的他還能撐多久？