阿笠博士送給柯南一幅追蹤犯人眼鏡，柯南本想把發(fā)信器粘在小蘭身上，卻陰錯(cuò)陽差的粘在了來偵探事務(wù)所找爸爸的雅美手表上，根據(jù)女孩提供的信息柯南在賽馬場(chǎng)找到了女孩的爸爸健三，事情本應(yīng)就此結(jié)束，可第二天傳來的卻是健三的死訊，擔(dān)心雅美有危險(xiǎn)，柯南利用追蹤器找到了一個(gè)高大的男人并非雅美，從柯南另一個(gè)參與此事的偵探口中得知此事并非尋人那么簡(jiǎn)單，深入調(diào)查過程中，又出現(xiàn)了一樁命案。

關(guān)西的名高中生偵探服部平次，為了合氣道比賽而來到帝丹高中。工藤新一與平次雖然沒見過彼此，在心里卻把對(duì)方當(dāng)成對(duì)手，可是表面上又裝出完全不在乎對(duì)方的樣子。後來平次在去帝丹高中的路上碰到搶匪，與毛利蘭一起在回家途中的新一，也一起幫忙追搶匪。後來是靠新一踢足球擊中搶匪，不過也同時(shí)打破一間民宅的玻璃，而里面還傳出女人的凄厲尖叫聲...

園子邀請(qǐng)柯南和小蘭到家中別墅度假而富澤財(cái)閥的別墅也建在旁邊。當(dāng)晚別墅突然停電而向外看時(shí)，柯南眾人正好目擊到富澤的父親被殺害的現(xiàn)場(chǎng)，凌子看到兇手的樣子，犯人竟然是死者的兒子熊三！在警方逮捕熊三時(shí)發(fā)現(xiàn)剛剛到達(dá)的老大和老二和熊三面貌竟然一模一樣。但在柯南的調(diào)查下最終鎖定了犯人并已園子的身份揭露了犯人的身份。

少年偵探團(tuán)幫隔壁班浩樹找貓的時(shí)候，無意中在一戶人家的浴室里發(fā)現(xiàn)尸體，柯南趕緊叫來警察調(diào)查，開門的是一個(gè)脾氣很差的大叔，柯南沖進(jìn)浴室卻發(fā)現(xiàn)尸體不見了，而這個(gè)大叔卻表示什么都不知道，自己則回二樓去睡覺讓警察隨便找，這時(shí)，臭脾氣大叔的弟弟回家并幫忙一起尋找，經(jīng)過一天的搜查，警察無獲而返，但是不甘心的偵探團(tuán)在夜里繼續(xù)調(diào)查，柯南一人潛入，卻遇到了危險(xiǎn)……

柯南注意到這些音符并將其解讀，這時(shí)，當(dāng)?shù)氐睦暇煺f倉庫里有麻生圭二留下來的樂譜，這種重要線索柯南自然不會(huì)放過，他和警察一起去找樂譜，而這期間，一直精神怪異的西本上吊死亡，腳下還留有遺書，柯南推斷出這是他殺，當(dāng)在看到麻生圭二留下來的樂譜后，柯南斷定出了兇手，他利用變聲領(lǐng)結(jié)和廣播室說出真相。