和珅與齊蘇圖懷疑紀(jì)曉嵐是裝瘋。為了檢驗(yàn)藥性，齊蘇圖抓來(lái)洪仁，用他做實(shí)驗(yàn)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)確實(shí)靈驗(yàn)。小月看出已經(jīng)被毒黑的碎銀可能是證據(jù)，于是細(xì)心保存起來(lái)。銀妃用銀票討好太后，以求太后給乾隆施加壓力，替齊家隱瞞罪證。厲春梅為古大力的安危擔(dān)心，古大力表示會(huì)努力讓厲家姐弟過(guò)上好日子。乾隆要懲治齊家，與小月來(lái)到工地冒充民工，救下了正要被齊家滅口的古大力等工匠。紀(jì)曉嵐趁杏兒做飯的工夫離家出走，走至厲家門口時(shí)被追殺工匠的齊家馬車撞倒。厲家姐弟將紀(jì)曉嵐扶回家療傷。乾隆和小月將工匠們帶到一荒廟，讓他們?cè)诖寺淠_。古大力對(duì)乾隆和小月的身份很是懷疑。為防不測(cè)。古大力帶領(lǐng)眾民工挖了一條暗道。紀(jì)曉嵐無(wú)意中得知遺失的兩枚元寶就在厲家姐弟手里，佯裝可以教厲小春識(shí)字而留在厲家。和珅見(jiàn)洪仁的病情越發(fā)厲害，于是讓劉全殺其滅口。小月和杏兒碰到了正趕車去郊外殺人滅口的劉全，小月感到其中有蹊蹺，于是將洪仁救回家。

左山傀無(wú)意中提到香積庵，紀(jì)曉嵐與趙青前去探訪。考場(chǎng)之外，和珅與敏德三人當(dāng)著小月做出嚴(yán)查之勢(shì)，實(shí)則根據(jù)考生文具上的標(biāo)記，使那些花錢作弊的考生順利進(jìn)入考場(chǎng)。正當(dāng)和珅得意之時(shí)，紀(jì)曉嵐趕到，將敏德手下負(fù)責(zé)搜檢考生的兵丁全部調(diào)換，并重新進(jìn)行檢查，將已經(jīng)蒙混過(guò)關(guān)的考生查出。趙青詫異于吳盛欽沒(méi)有參加恩科考試，吳盛欽卻表示自己以重金賄賂考官，不用考試也能坐上官椅。和珅發(fā)現(xiàn)趙青欲找紀(jì)曉嵐告發(fā)此事，便派人將其劫持到香積庵以滅口。和珅等人本以為考試結(jié)束便萬(wàn)事大吉，誰(shuí)知紀(jì)曉嵐提出為了避免考生在試卷上留暗語(yǔ)作弊，要找人重抄試卷。正當(dāng)趙文龍及眾閱卷官不知如何是好時(shí)，左山傀想出一計(jì)。

戲園被圍，福康安領(lǐng)兵搜查后臺(tái)，紀(jì)曉嵐自言貪戀風(fēng)情，才流連忘返，極力為莫愁、小月開(kāi)脫罪名，且出謀劃策，鼓勵(lì)二人告倒贓官、為民伸冤，聽(tīng)得與此案有干系的和與福康安是心驚肉跳。 四姑娘探知皇上要微服去燕城尋母，慫恿十四王爺借機(jī)取而代之；和等為自身利益謀，深怕失去對(duì)自己寵幸有加的保護(hù)傘，極力阻撓皇上出行。不想皇上尋母心切，哪里聽(tīng)得進(jìn)去。并邀小月、莫愁和紀(jì)曉嵐相伴，風(fēng)塵仆仆直往燕城而去。一路所見(jiàn)，多是當(dāng)?shù)貫?zāi)民之慘狀，頗為痛心疾首。亦下定決心，要紀(jì)曉嵐查清事實(shí)，嚴(yán)加處置那些魚(yú)肉百姓的貪官污吏。 一行人初到燕城，與守城衛(wèi)兵發(fā)生沖突，雙方大打出手，為免泄露身份，紀(jì)曉嵐與小月、莫愁與“許仙”各扮夫妻住進(jìn)“天龍客棧”。客棧掌柜被蒙蔽，誤將他們認(rèn)作是“軍機(jī)大臣和”。 和、福康安合謀利用十四王爺篡位之野心來(lái)轉(zhuǎn)移皇上的注意力。 莫愁無(wú)意間由“許仙”手中的一把折扇了解到眼前之人乃是九五之尊的當(dāng)朝天子，不禁百感交集，日思夜想為民除害，未知一國(guó)之君近在眼前。

了凡記錄下來(lái)的涉及徇私舞弊的人員名單顯示敏德正是首貪。看到確鑿證據(jù)，乾隆下令抓捕敏德。收到和珅的消息，敏德連夜逃走。紀(jì)曉嵐建議乾隆從嚴(yán)查處涉案人員以警示世人，并重新閱卷以示公正。趙新進(jìn)看到自己榜上有名，欣喜不已。敏德借和珅之名要見(jiàn)紀(jì)曉嵐，紀(jì)曉嵐不知有詐，被敏德襲擊。關(guān)鍵時(shí)刻，趙青救了紀(jì)曉嵐一命，自己卻受傷。乾隆下令斬首敏德，并決定重開(kāi)恩科。和珅依然擔(dān)任主考官。紀(jì)曉嵐帶小月去專賣應(yīng)考用具的“連升店”，看到無(wú)奇不有的作弊工具，還有一間名為“獨(dú)占鰲頭”的書(shū)院。

紀(jì)曉嵐與和聯(lián)手派人護(hù)送御醫(yī)呂長(zhǎng)安安在回京，這對(duì)多年來(lái)的冤家對(duì)頭即使在相互合作時(shí)也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長(zhǎng)安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍?zhǔn)祝矍凹埌蛔』穑庪U(xiǎn)毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀(jì)曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見(jiàn)自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無(wú)情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內(nèi)，皇上召見(jiàn)文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀(jì)曉嵐巧設(shè)圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協(xié)助自己調(diào)查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應(yīng)召入宮見(jiàn)駕，藥方奇案終于到了真相大白的時(shí)候。